三国时开凿的车箱渠、元代开凿的金口河都曾流经乡域。1958年8月30日，玉渊潭人民公社成立，1960年11月，在玉渊潭公社设玉渊潭街道办事处，与公社“一套机构，两块牌子”。1963年3月，街道、公社机构分设，在玉渊潭公社设“玉渊潭乡”。“文化大革命”中取消“乡”的含义。1984年4月9日，设玉渊潭乡，乡集体经济组织定名为农工商总公司。1990年12月，成立乡“经济合作总社”，与总公司为“一个组织，两个名称”，在各行政村设经济合作分社。