2000-2001，主持“水生生物学（形态和分类）”CAI制作。

2001-2003，主持上海市重点课程“水生生物学”建设项目。

2002-2004，住宅小区人工湖水质处理技术，第二主持！

2002-2003，延中绿地人工湖水质处理技术，第二主持。

2003-2004，863项目“深海抗风浪网箱养殖的研究”的子课题“深水网箱养殖海区环境动态研究”

2002-2003，山泉水生产中常见微藻的生物学及有效控制研究，第二主持

2003-2004，国家重点学科水产养殖科研基金项目“小对叶和红蛋的组织培养”

2004-2010，主持新疆特克斯河流域饵料生物资源调查。

2004-2005，参加千岛湖初级生产力及渔产潜力测定，千岛湖保水渔业工程、

2003-2006，主持教委青年基金项目“两种枝角类对水华蓝藻的摄食研究”

2005-2008，参加淀山湖底栖动物多样性及生态学研究、

2005-2008，主持“淀山湖浮游植物群落演替及其环境响应”

2005-2009，主持世茂佘山庄园景观河道水处理工程项目。

2006-2007，主持江苏908海洋生资源调查-浮游生物部分，

2006-2007，主持世茂常熟世纪新城中心湖生态水处理项目

2007-2008，主持新疆水利厅“水利工程对克孜河流域水域生态环境的影响”

2006-2009，主持朱家角大淀湖水环境生态治理及水质长效管理和维护。

2009-2011，国家水专项子课题“滆湖自净能力增强技术研究与工程示范”；

2009-2011，国家水专项子课题“南方丘陵和河网水系水生生物种群与水环境关系”；

2008-2010，主持博士启动基金项目“淀山湖浮游植物群落演替及其环境响应”；

2008-2010，主持上海市水务局“淀山湖富营养化控制和生态修复综合示范试验性工程”项目；

2008-2010，主持上海市科委重大项目“淀山湖水体富营养化和蓝藻水华控制技术研究”；

2009-2011，主持上海市科委项目子课题“人工湿地水处理系统在标准化水产养殖中的应用”；

2008-2011，上海市科委重大项目“青草沙水库生态系统构建与水体自净能力增强技术研究”

二、 发表的论著、论文

教材、论著：

1． 全国高等农业院校教材《水生生物学》。2005年，中国农业出版社。副主编。

2． 水产辞典。2007，上海辞书出版社。参编。

论文：

1． 姜新耀，王丽卿，陈马康，1997。塥湖有机碎屑组成及现存量的研究。塥湖渔业高产模式及生态渔业研究论文集，164-173.

2． 姜新耀，王丽卿，1997。塥湖水域中细菌生长速率的测定及其动态研究。上海水产大学学报，6(4)：258-262.

3． 邱高峰，徐巧婷，王丽卿等。四种绒螯蟹的分子分类及进化。动物学报，2001，47(6): 640-647.

4． 王丽卿，无齿相手蟹的幼体发育。上海水产大学学报，2001，10(3): 199-206.

5． 王丽卿，天津厚蟹的幼体发育。海洋科学集刊，2002，44：139－150.

6． 王丽卿，王为东，臧维玲等，河口区斑节对虾淡化养殖塘浮游生物状况。上海水产大学学报，2002, 11(2):118-123.

7． 王丽卿，黄旭雄，不同营养盐浓度下微绿球藻的生长及水体中氮磷的变化。上海水产大学学报，2002,11(3)：215-218.

8． 王丽卿，周胜耀，蔡文卫等，水生生物学多媒体课件设计与制作。高等教育管理的研究与探索，2002：85-90.上海交通大学出版社.

9． 王丽卿，陈杨建，狭颚绒螯蟹的幼体发育。水生生物学报，2002，27(5):457-462.

10．Wang liqing, Liang xiangqiu, A new species of Caridina from Yunnan。Acta zootaxonomica Sinica. 2005. 30(4):748-750.

11．王旭晨，王丽卿（通迅作者），彭自然等，应用灰色聚类评价淀山湖水环境质量。上海水产大学学报，2006，15(4):497-502.

12．王丽卿，季高华等，4种观赏水草的组织培养实验。水产科技情报，2006，33(2):84-86.

13．季高华，王丽卿，张瑞雷等，4种化学试剂对三种藻液的浓缩效果。水产科技情报，2006，(4):157-159.

14．王丽卿，黄旭雄，任文青，山泉水生产过程中微藻污染途径分析。环境与健康杂志，2006，23(6):530-532.

15．季高华，李燕，王丽卿等，光照对苦草种子发芽和生长的影响。科学养鱼，2006，7:43-44.

16．李燕，王丽卿（通迅作者），张瑞雷，大型水生植物的生态功能及其应用。环境污染与防治（网络版），2007，5.

17．盖建军，王丽卿（通迅作者），刘其根等，千岛湖浮游甲壳类群落结构特征初步研究。上海水产大学学报，2007，16(6):560-565.

18．王丽卿，张军毅，彭自然等，淀山湖水体叶绿素a与水质因子的多元分析。上海水产大学学报，2008，17（1）：58-64.

19．李燕，王丽卿（通迅作者），张瑞雷，5种沉水植物死亡分解过程中氮磷营养物质的释放。环境污染与防治，2008，30（2）：45-48.

20．Wang Liqing, Liang Xiangqiu & Li Fan, Descriptions of four new species of Caridina (Decapoda: Atyidae) from China. Zootaxa,2008,1726：49-59.

21．王丽卿，李燕，张瑞雷，沉水植物系统对淀山湖水体净化效果的试验研究. 农业环境科学学报.

22. 张玮, 王为东，王丽卿. 嘉兴石臼漾湿地冬季浮游植物群落结构特征. 应用生态学报. 2011. 22(9):2431-2437.

23. 王丽卿, 许莉，陈庆江,鲢鳙放养水平对淀山湖浮游植物群落影响的围隔实验,环境工程学报. 2011,5(8):1790-1794.

24. 王丽卿,许莉,卢子园.淀山湖浮游植物数量消长及其与环境因子的关系.环境科学，2011,32(10):2868-2874.

25. 王丽卿, 施荣, 季高华, 范志锋, 程婧蕾. 淀山湖浮游植物群落特征及其演替规律[J]. 生物多样性, 2011,19(01): 48-56.

26. 张玮，郑晓燕, 王丽卿，上海辰山植物园沉水植被恢复后水质变化特征研究. 环境工程学报.2012. 6(1):178-184.

27. 王丽卿，张玮，范志锋,等. 淀山湖生态示范区附着藻类季节动态变化研究. 农业环境科学学报,2012,31（8）:1596-1602.

1997，荣获宝钢教育奖。

2000，评为校级“三八”红旗手。

2000，荣获校“建功创业”在讲台教学竞赛优秀奖。

2002，负责《水生生物学》校级重点课程建设荣获一等奖。

2003，主持完成的重点建设课程“水生生物学” 荣获校级课程建设“一等奖”。

2004，主持完成的“水生生物学课程教学改革及实践”荣获校级教学成果“一等奖”。

2004，负责建设的“水生生物学”课程荣获上海市精品课程。

2004，评为校级师德标兵。