清同治元年（1862）为优贡生，同治六年中举人。后2次应试不第，遂一意讲学论著，说；“吾无意作官，恐得一令，更累我也”，以发明学术、表彰先贤、启迪后进为终生之志。历任书院山长有：黄岩九峰、清献和文达，处州莲城，温州中山、东山、肄经，太平宗文，临海正学，江西南昌经训。王棻博学通经，崇尚宋明理学，赞颂民族气节，常以抗清志士吕留良等人事迹教育学生。提倡读书应明理义，不是为做官。以“左交许郑右程朱①，要使滨海变邹鲁”作为教育宗旨，台州近代学者喻长霖、王舟瑶、章梫、朱谦、管世骏、黄方庆等均出于门下。光绪八年（1882），江西乡试，一半以上中举出自王棻执掌的书院。

王棻深感黄岩藏书不足，多方搜集经史典籍，发掘乡邦文献。同治七年赴考时，在京师借得失传的明抄本《杜清献集》，日夜抄录，并撰《杜清献年谱》作附集一起付梓。向“玉海楼”②借台州古籍，刻印宋车若水《脚气集》、明方孝孺《逊志斋集》。王棻执掌九峰书院先后十余年，注重文化事迹，将江西学政赠银3000两，购《古今图书集成》等庋藏名山阁藏书楼，还收藏历代大型类书《太平御览》、《册府元龟》、《渊鉴类函》、《古逸丛书》、《武英殿丛书》等，计各类书籍3万余卷。