王邃与琅邪王氏家族南迁后，曾于东晋任中领军。东晋永昌元年（322），王敦于江州举兵，进攻建康，晋元帝加王邃任尚书右仆射。一个月后，朝廷兵败。王敦攻陷建康，掌握朝政，将王邃出任下邳内史。同年十月，王敦又升下邳内史王邃为征北将军，都督青、徐、幽、平四州诸军事，镇守淮阴。

东晋太宁元年（323年），后赵君主石勒攻陷下邳（今江苏省邳州市南），徐州刺史卞敦与王邃退守保卫盱眙。太宁二年（324年），晋明帝得知王敦打算进攻建康并篡夺帝位，于是积极准备抵抗，其中征召平北将军、徐州刺史王邃与豫州刺史祖约等人入卫建康。其后事迹不详。（东海据《晋史》略补正）

门荫入仕，爱好书法，累迁中领军、右仆射。王敦之乱后，出任下邳太守、征北将军，册封海陵侯。