目前，该所是国控站之一，承担国控大气、地面水和饮用水源地、淡水生物、环境噪声、放射性等领域环境监测、科研任务。所内设有空气监测研究室、仪器研究室、化学监测研究室、海洋放射监测研究室、监督监测研究室、综合评价研究室、技术管理室等9个科室。近几年，该所还开展了如环境监测仪器研制、水污染整治技术研究、区域和专题环境调查与评价等工作。“七五”、“八五”期间，承担了多项国家科技攻关项目及省部级科研课题，并有多项获奖。如“青岛地区酸沉降研究”、“HY-1多功能极谱仪研制”、“DK-12电子控制大气采样器”等等，有的已转让给国内专业生产厂家。 该所技术力量雄厚，具有国内一流的监测仪器设备及分析监测的多学科配套的条件，有一支理论基础和实践经验丰富的科研队伍，愿与国内同行在海洋环境、污染防治技术、大气环境等领域进行广泛的合作研究。目前，该所在完成国控点监测任务的同时，主要开展工作的重点是，提高海洋环境监测、研究的整体实力，提高大气监测与预测、预报的科学水平。