1996年，经公安部同意、省政府批准成立甘肃政法学院公安分院，由甘肃政法学院和甘肃省公安厅双重领导。

2016年4月，为主动适应国家关于公安院校公安专业人才招录培养制度改革的政策性调整，经学校党委研究决定，在公安分院的基础上组建刑事司法学院。

2020年12月，甘肃省司法厅决定与甘肃政法大学共同成立、共同领导管理司法警察学院。

2021年5月，经学校党委研究决定，撤销刑事司法学院建制。司法警察学院与公安分院实行“两块牌子，一套班子”的管理机制。