病原菌以菌丝体在罹病的枝干韧皮部组织中越冬。菌丝在寄主细胞间隙生长，并有部分菌丝挤破细胞而侵入胞腔内。未枯死的病枝干，每年秋季在病皮上溢出蜜滴，为性孢子混合液。翌年春季从病皮裂缝中产生锈孢子器。锈孢子成熟后，随着疱囊破裂而散出。锈孢子经风传播，萌发并由气孔侵入转主寄主叶片和嫩茎，产生夏孢子堆，夏孢子可反复多次侵染转主寄主植物。初秋，在夏孢子堆中或周围陆续出现冬孢子柱，成熟的冬孢子在适宜的条件下，经4h就开始萌发产生担子及担孢子。担孢子经风传播侵染松树针叶，尔后菌丝由针叶延伸至侧枝皮层。从担孢子侵染至松树发病，其潜育期往往需要几年。锈孢子器出现的早迟与4月上旬温度呈正相关，当旬平均温度在15℃以上，疱囊出现早，反之则迟。降雨对疱囊的破裂有促进作用，并且大雨还能冲刷疱囊。风则对病原菌的传播起着媒介作用。在适宜的环境中，樟子松与芍药等转主寄主的距离越近，发病就越严重。