传说清初，有比丘法名仁果，披星戴月，历尽艰辛，化缘济世，始建“白云宫”。后于清康熙九年（1670年）岁次庚戌圆寂于该寺，葬于白云寺后右侧灵山之腰，面朝大印山。清道光二十年（1840年）, 白云寺曾遭海丰知县派兵烧毁。清同治二年（1863年）重建。大革命时期至抗日战争时期，该寺曾作为革命活动据点，开展革命工作。1966年，该寺被拆毁，当时，信众郑炳、温华钦将白云寺光绪年间李振干所赠的香炉、地藏王玉石身等文物保护（今尚存）。

1988年，由当地佛教信众发起复建，1990年，经政府宗教工作部门依法批准为临时宗教活动场所，并易名为白云寺，1994年批准登记为宗教活动场所。

山清水秀梵楼地载现华颜