2008年、东京――。

その研究段阶で作り出され、エマ、沙友、透花と名づけられた三人の少女达は、追加された24対目の遗伝子ゆえに『エクストラ』と呼ばれていた。表面的には穏やかに见えた彼と彼女达の日常は、研究所に侵入してきた正体不明の军事ロボットとの戦いを境に変化する。

さまざまな事件を乗り越え、徐々に明らかになっていく计画の全容とそれぞれの真の目的、エクストラに関わる人间たちの悲しい过去。エクストラの兵器としての性能を知り、暗跃を始める军部。独自の正义に基づいて动く、公安のナンバーレスエージェント『荒山鸟人』。津名川にライバル意识を燃やすもう一人のエクストラ开発者『高宫エレン』。