某夜，一辆封闭式运输车发生车祸，一只实验小白鼠从毁车中逃入黑暗，一种致命的传染病毒开始悄悄逼近，第一名感染者刘元由社工人员谢欣欣送往医院。这种病毒极具迷惑性，严亮等主治医生将刘元定为一般感冒，使唯一目睹刘元发生症状的欣欣极为不满，刘元终被确疹为感冒的病毒夺去了生命，而严亮的好友陆斌身上也出现了相同症状。刘元的尸检证明了确实有一种不知名的病毒存在，而隔离治疗中心的陆斌溜出病房操作股票，悴死在途出。严亮终于向院方提出警告，发现一种新型病毒，短期内它像格式化磁片一样洗去人的记忆，最后使人丧失包括呼吸在内的身体机能，病毒在进一步的扩散，接二连三的发现潜伏期患者，刘元的母亲临终前才告诉了严亮，刘元是被牛奶感染的，严亮与欣欣追查到现代化的牛奶工厂，几经波折，终于证明这里的奶牛感染病毒大批悴死，而那批奶牛早已输送到这座城市的各个角落。于是市长下令，城市开始区域性隔离，恐怖和病毒一起扩散，而医院特设的临时隔离区也爆满，一直没有治疗的办法，从隔离区送向太平间的患者也越来越多，邱月琴从病毒症状中认识到，真正的病源体来自研究所正在研制生物药物，她开始调查陈查理隐瞒的一次车祸，却反被陈查理以同谋相威胁，难以决断。