《瞿塘烽烟厅》，该展厅内展示了瞿塘关模拟全景图。左侧为距今1800年的汉砖砌成的仿古城墙。右侧为抢救切割的瞿塘峡黑石滩奇石砌成的石壁。展厅两侧的墙壁上，悬挂由瞿塘峡摩崖石刻搬迁前留下的巨幅“夔门”、“瞿塘”石刻拓片，以及当地出土的兵器文物。

《观景长廊》，该展厅依山而建，除白帝城观音洞搬迁的观音造像以及清光绪年间“云行雨施”碑外，还刊刻了弘一法师“无边境界”等墨迹。长廊内侧，为三峡水陆画以及三峡女神俑展厅。其中三峡女神厅所展示的东汉女裸跪式俑，均为巫山出土。是三峡先民对母性生殖崇拜的真实写照，为深入研究巫山神女神格属性提供了珍贵的实物资料。

《云根堂》，该展厅是以杜甫“入天尤石色，穿水忽云根”诗意命名，由国画大师黄永玉题额，堂内外陈列了三峡地区乃至国内外都较为有名的珍惜古木一三峡阴沉木。巨大的古木树龄大都在两千年左右，埋藏时间约七千年。是三峡自然生态的实物见证，同时也具有较高的艺术观赏性。云根堂集中展示的魏靖宇花费数十载心血收藏的上百件埋藏期约七千年、树龄约二干年的巨大阴沉木。云根堂内，木板刻制冯其庸《瞿塘石歌》。范曾《题靖宇木雕》。陈立夫《天人合一》、黄苗子《万木堂》。云根堂户外陈列了水位上涨之前从水位线附近切割保存下来的三峡奇石，是三峡古生态的实物见证。

奉节县瞿塘关遗址博物馆馆内藏品类别包括陶器、瓷器、青铜器、三峡生态遗物、名人书画、碑刻等类别。据中国博物馆志显示，馆内馆藏文物600件/套。截至2019年末，奉节县瞿塘关遗址博物馆馆内藏品数量163件/套，其中珍贵文物23件/套。

奉节县瞿塘关遗址博物馆重要藏品有东汉女裸跪式俑，高50厘米，双目大而突出，头扎双发醫，全身赤裸，两膝跪在地上，一手抚乳房，一手托腹部，独特的造型，充满令人遐想不已的历史感和神秘感。

奉节县瞿塘关遗址博物馆是经重庆市文物局正式批准成立的三峡地区的民办博物馆。

瞿塘关遗址博物馆是重庆市文物局批准建立的非国有博物馆。营运年收入（含旅游纪念品销售）20万元。因瞿塘关遗址博物馆处在景区内，独立正常运营受到相当限制。又因为其遗址博物馆的性质，无法享受国家免费开放的政策。瞿塘关遗址博物馆已经连续多年入不敷出。

奉节县瞿塘关遗址博物馆下设3个部门。

奉节县瞿塘关遗址博物馆在编人员7人。专业技术人员3人。工勤4人。其中具有专业技术资格（资质）人员3人，副高级1人、中级1人、初级1人，高、中、初级专业技术人员比例适当，人才结构梯次结构合理。

奉节县瞿塘关遗址博物馆在人力资源、安防设施上均按照4A景区对外开放要求设置。建成开放以来，在游览、安全、卫生、资源、环境保护和综合管理等方面投入大量的人力和物力，树立了良好的社会形象。

截至2019年末，奉节县瞿塘关遗址博物馆年均接待观众达6.5万人次。

奉节县瞿塘关遗址博物馆位于重庆市奉节县白帝城瞿塘峡风景区。

全年开放。

免费。

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