更新时间：2023-01-06 09:33
民国时期，设置瞿昙乡。
1950年，沿旧制设瞿昙乡。
1958年，成立瞿昙公社。
1984年，复设瞿昙乡。
2006年9月13日，撤销乐都县亲仁乡，并入瞿昙镇。
2011年，瞿昙镇下辖1个社区和35个行政村：瞿昙社区，新联、磨台、河西、徐家台、斜沟门、官隆湾、朵巴营、角营、斜上、斜中、斜下、浪上、浪下、龙占沟、石坡沟、台沿、车路、阳坡、阴坡、中庄、祁家、中心、隆国、韩家、晁家、口子、魏家、红庄、盛家、大树、脑庄、杨家、周家、窑庄、段家。
截至2019年10月，瞿昙镇下辖1个社区和35个行政村：瞿昙镇社区，新联村、河西村、徐家台村、磨台村、斜沟门村、斜下村、斜中村、斜上村、朵巴营村、龙占村、官隆湾村、角营村、浪上村、浪下村、石坡村、台沿村、中心村、车路村、阴坡村、阳坡村、中庄村、隆国村、韩家村、祁家村、口子村、脑庄村、大树村、红庄村、盛家村、魏家村、杨家村、段家村、周家村、窑庄村、晁家村。
瞿昙镇地处湟水谷地南部脑山地带，地势南高北低，镇域内平均海拔2500多米，以沟谷地和山丘陵为主。
瞿昙镇属大陆性高原气候，年均气温4.8℃，年均降水量400毫米。
瞿昙镇境内自然灾害频发，主要以旱灾为主，时而还有雹灾。
瞿昙镇境内有自然林，草山宽阔；野生药用植物有黄芪、冬虫夏草等。境内野生动物有山鸡、雪鸡等。
2011年末，瞿昙镇辖区总人口22865人。总人口中，以汉族为主；有藏、蒙古等少数民族。
截至2018年末，瞿昙镇户籍人口有21270人。
瞿昙镇农作物以小麦、马铃薯、油菜、蔬菜为主。2011年，农作物种植面积3.6万亩，其中小麦0.2万亩，马铃薯2.3万亩，油菜0.6万亩，蔬菜0.5万亩。畜牧业以饲养生猪、牛、羊、家禽为主。2011年末，畜禽饲养量13.7万头（只），其中生猪3.7万头，牛0.4万头，羊4.8万只；家禽4.8万只。2011年，生产肉类2134吨；禽蛋293吨，牛奶152吨；毛65吨；畜牧业总产值3400万元。林业以种植苗木为主。2011年，种植苗木366.3万株，其中榆树212.9万株，沙棘153.4万株；退耕还林（草）补植补种2.5万亩；荒山造林栽植云杉8300亩，公路两旁绿化12千米。2011年，栽植大樱桃150亩，8400株；圆柏6688株，丁香3665株，山杏1000株，一叶梅470株。
2011年，瞿昙镇有主要学校7所，其中有乐都第三中学、中庄中心学校、磨台中心学校等，在校生1726人。
2011年末，瞿昙镇农家书屋藏书1万余册。
2011年末，瞿昙镇有中心卫生院2个，每个村都设有村医疗室，配备乡村医生。2011年末，参加合作医疗17821人，共收缴参合金445890元。其中低保户2863人，五保户75人，优抚对象20人，实际缴费人口14863人，参合率达98.51%。
2011年末，瞿昙镇参加养老保险8850人，共收缴参保金110.69万元，参保率达90%。
瞿昙镇境内有G213公路穿过。
瞿昙镇因境内瞿昙寺而得名。
瞿昙镇境内有全国重点文物保护单位瞿昙寺，始建于明洪武年间。省级重点文物保护单位药草台寺，坐落在瞿昙镇台沿村，距瞿昙镇人民政府9千米。瞿昙镇“花儿会”历史悠久，自清道光年间开始，到清末民初逐渐发展成一定规模的“花儿会”。以参加人数多、庙会规模大而享誉西北。