石河子大学医学院（塔里木大学）分院校区设在新疆阿拉尔市塔里木大学，是南疆唯一的招收医学本科专业的院校。分院现有专、兼职教师112人，其中“全国教育先进工作者”1人，兵团学术技术带头人1人，享受政府特殊津贴专家2人，研究生导师3人。附属医院1所，教学实习基地14所；开设有临床医学、预防医学2个本、专科专业。

分院秉承“立足兵团、服务新疆、面向全国、辐射中亚”的办学定位，彰显“用胡杨精神育人、为兴疆固边服务”的办学特色，坚持培养适应区域经济社会发展需要的高素质应用型医学人才。