矿质化的速度和产物，受土壤有机质的种类和组成，土壤环境条件和土壤微生物种类的影响。在好气条件下，其分解产物主要有二氧化碳、水、氨和硝酸盐等；在嫌气条件下，其分解产物除二氧化碳和水外，还有甲烷、硫化氢和简单有机酸等。农业上，常通过调节土壤水热状况来控制矿质化的进程。借以避免有害作物的硫化氢、有机酸等物质的积累；控制有机结合态养分转变为植物可给态的速率。