2017年5月6日晚，在武汉进行的2017年全国体操锦标赛暨全运会预赛结束了第二日争夺，在四个单项上，河南队刘津茹以14.275分列女子跳马第一，北京队祁琦以14.200分列第二，北京队王妍以13.900分列第三。5月8日下午，在武汉进行的2017年全国体操锦标赛结束了五个单项的争夺，女子跳马，最终刘津茹获得冠军，祁琦获得亚军，虞琳敏获得季军。

2018年全国体操锦标赛暨亚运选拔赛女子团体争夺，北京队由杜思雨、唐茜靖、祁琦、杨海蒙、林雨遥、王佳蕊组成，北京队以206.700分摘得银牌。

2019年9月16日，中国体操队公布参加2019年世界体操锦标赛名单，祁琦入选。10月13日，斯图加特体操世锦赛，祁琦获得世锦赛女子跳马第五名。

2020年9月26日，在广东肇庆举行的2020年全国体操锦标赛女子个人全能决赛中，祁琦以109.950分的总成绩获得季军。10月24日，在全国体操冠军赛女子跳马项目中，祁琦以13.933的成绩折桂。女子自由操决赛，祁琦以14.200分获得金牌。