后来他又取道汤阴（今河南省安阳市汤阴县）之伏道社，渡黄河经长清（今山东省济南市长清区），于公元前357年到了齐国的都城临淄（今山东省淄博市临淄区）。蔡桓公派人招待他，桓侯接见时，他望着桓侯的颜色，便说：“君有疾在腠理，不治将深。”桓侯答道：“寡人无疾”。他离开后，桓侯就对左右的人说：“医之好利，欲以不疾为功。”过了五天，他见到桓侯又说：“君有疾在血脉，不治恐深。“桓侯仍答道：“寡人无疾。”他辞出后，桓侯感到很不高兴。过了几天，再看见桓侯时，他又郑重地说：“君有疾在肠胃间，不治将深。”桓侯很不愉快，没有理睬。又过了几天，扁鹊复见桓侯。看见桓侯的脸色，吃惊的溜走了。桓侯便派人追问原因，他说：“疾之居腠理，汤熨之所及；在血脉，针石之所及，在肠胃，酒醪之所及；其在骨髓，虽司命无奈之何，今在骨髓，臣是以无请。”不久桓侯病发，派人去请他治疗，可是他已取道魏国，跑到秦国去了。桓侯终因病深，医治无效而死去。

在公元前355年前后的一段时间里，他和弟子子阳、子豹等人，都逗留在那里行医。大约于公元前317年，他们又取道周都洛阳(今河南省洛阳市)，听说当地的人民很敬重老人，因此，曾为“耳目痹医” （五官科、疯科医生）。后来他们又向咸阳而去。

公元前310年，扁鹊再度来到咸阳，因咸阳的人民很爱小儿，所以他就做了“小儿医”。扁鹊及其弟子不辞艰辛，行程四千余里，周游列国，济世救人；他们“随俗为变”，成为医、药、技非常全面的“全科医生”。

扁鹊名声传扬天下。他到邯郸时，闻知当地人尊重妇女，就做治妇女病的医生；到洛阳时，闻知周人敬爱老人，就做专治耳聋眼花四肢痹痛的医生；到了咸阳，闻知秦人喜爱孩子，就做治小孩疾病的医生；他随着各地的习俗来变化自己的医治范围。秦国的太医令李醯自知医术不如扁鹊，派人刺杀了扁鹊。天下谈论诊脉法的人，都遵从扁鹊的理论和实践。

秦武王与武士们举行举鼎比赛，不觉伤了腰部、疼痛难忍，吃了太医李醯(音西)的药，也不见好转，并且更加严重。有人将神医扁鹊已来到秦国的事告诉了武王，武王传令扁鹊入宫。扁鹊看了武王的神态，按了按他的脉搏，用力在他的腰间推拿了几下，又让武王自己活动几下，武王立刻感觉好了许多。接着又给武王服了一剂汤药，其病状就完全消失。武王大喜，想封扁鹊为太医令。李醯知道后，担心扁鹊日后超过他，便在武王面前极力阻挠，称扁鹊不过是“草莽游医”，武王半信半疑，但没有打消重用扁鹊的念头。

李醯决定除掉扁鹊这个心腹之患，派了两个刺客，想刺杀扁鹊，却被扁鹊的弟子发觉，暂时躲过一劫。扁鹊只得离开秦国，他们沿着骊山北面的小路走，李醯派杀手扮成猎户的样子，半路上劫杀了扁鹊。

扁鹊在诊视疾病中，已经应用了中医全面的诊断技术，即后来中医总结的四诊法：望诊、闻诊、问诊和切诊，当时扁鹊称它们为望色、听声、写影和切脉。他精于望色，通过望色判断病证及其病程演变和预后。扁鹊精于内、外、妇、儿、五官等科，应用砭刺、针灸、按摩、汤液、热熨等法治疗疾病，被尊为医祖。

扁鹊的切脉诊断法也很突出，具有较高水平。《史记》称赞扁鹊是最早应用脉诊于临床的医生。先秦时期，中医的脉诊是三部九候诊法，即在诊病时，须按切全身包括头颈部、上肢、下肢及躯体的脉。扁鹊是我国历史上最早应用脉诊来判断疾病的医生，并且提出了相应的脉诊理论。

扁鹊十分重视疾病的预防。从蔡桓公这个案例来看，他之所以多次劝说及早治疗，就寓有防病于未然的思想。他认为对疾病需要预先采取措施，把疾病消灭在萌芽里，这样可以达到事半功倍的效果。他曾颇有感触地指出：客观存在的疾病种类很多，但医生却苦于治疗疾病的方法太少。

在治疗方面，扁鹊能熟练运用综合治疗的方法。综合疗法为扁鹊行医时的主要治疗措施。先秦时期，在临证中，医学尚未明确分科。尽管《周礼》中已有兽医、食医、疾医和疡医之分，但这仅仅是在宫廷中的设置。兽医、食医、疡医分别管理牲畜疾病、宫廷饮食调配和以刀剪割切的外科等事项。除此以外的其他病证，都属疾医的范畴。扁鹊是一位能兼治各科疾病的多面手，扁鹊还能根据当地的需要，随俗为变地开展医疗活动。据记载，扁鹊还精于外科手术，而且应用了药物麻醉来进行手术。

扁鹊奠定了祖国传统医学诊断法的基础。难怪司马迁称赞他说：“扁鹊言医，为方者宗。守数精明，后世修(循)序，弗能易也。”

他用一生的时间，认真总结前人和民间经验，结合自己的医疗实践，在诊断、病理、治法上对祖国医学作出了卓越的贡献。扁鹊的医学经验，在我国医学史上占有承前启后的重要地位，对我国医学发展有较大影响。因此，医学界历来把扁鹊尊为我国古代医学的祖师，说他是“中国的医圣”、“古代医学的奠基者。”范文澜在《中国通史简编》称他是“总结经验的第一人”。

司马迁在《史记·扁鹊仓公列传》中说：“女无美恶，居宫见妒；士无贤不肖，入朝见疑。故扁鹊以其伎见殃，仓公乃匿亦自隐而当刑。缇萦通尺牍，父得以后宁。故老子曰'美好者不祥之器'，岂谓扁鹊等邪?”

日本医师滕惟寅说：“扁鹊，上古之神医也。”

传说鲁公扈、赵齐婴二人有轻病，就一起请扁鹊治病，扁鹊对公扈说：“你的志气强身体却很弱，有计谋却并不果断，齐婴你的志气弱身体却很好，没有谋虑却过于执著。如果把你们的心脏互换，就能平衡病也就好了。”扁鹊让二人喝了药酒，他们昏死了很多天，剖开他们前胸找到了心脏，将它们互换放置好，然后给他们吃了神药，于是二人过了一会便醒了，就像刚开始一样的健康，后来二人就向扁鹊告辞回家了。

传说一次扁鹊到了虢国，听说虢国太子暴亡不足半日，还没有装殓。于是他赶到宫门告诉中庶子，称自己能够让太子复活。中庶子认为他所说是无稽之谈，人死哪有复生的道理。扁鹊长叹说：“如果不相信我的话，可试着诊视太子，应该能够听到他耳鸣，看见他的鼻子肿了，并且大腿及至阴部还有温热之感。”中庶子闻言赶快入宫禀报，虢君大惊，亲自出来迎接扁鹊。

扁鹊说：“太子所得的病，就是所谓的‘尸厥’。人接受天地之间的阴阳二气，阳主上主表，阴主下主里，阴阳和合，身体健康；现在太子阴阳二气失调，内外不通，上下不通，导致太子气脉纷乱，面色全无，失去知觉，形静如死，其实并没有死。”

扁鹊命弟子协助用针砭进行急救，刺太子三阳五会诸穴。不久太子果然醒了过来。扁鹊又将方剂加减，使太子坐了起来。又用汤剂调理阴阳，二十多天，太子的病就痊愈了。这件事传出后，人们都说扁鹊有起死回生的绝技。

《汉书·艺文志》载《扁鹊内经》《扁鹊外经》，均佚。现存《难经》系后人托名扁鹊之作。

天回医简被整理为《脉书·上经》《脉书·下经》《逆顺五色脉臧验精神》《犮理》《刺数》《治六十病和齐汤法》《经脉》与《疗马书》等8部医书，涉及医学理论、治法、成方制剂文献等内容，构成了一门系统的医学体系。天回医简就是失传2000多年的“扁鹊医书”。

扁鹊在中医史上的历史地位，司马迁曾说：“扁鹊言医，为方者宗。” 隋唐以来，扁鹊在中医史上的地位从“医宗”变成了“岐黄术”的传人。关于扁鹊的活动年代问题，历史学者聚讼不已。大体而言，古代学者多倾向于扁鹊与赵简子生活在同一时代，即扁鹊为春秋末年的名医。 而当代学者中却多因扁鹊为赵简子诊病一事的记载中有怪诞内容而宁愿相信扁鹊是战国时的名医。据《史记· 赵世家》所云，扁鹊为赵简子诊病并受简子赏赐田四万亩当是董安于记载下来的。而从《国语》中董安于自述其经历的史料，可证董安于年少时确为赵家史臣。

大量史料、遗迹证实，内丘蓬鹊山为扁鹊学医、行医、采药，赵简子赐田、封赠食邑，虢太子从师、学医之地。现保存着历史最为悠久，规模最为弘大的扁鹊祠。司马迁撰《史记·扁鹊仓公列传》之《扁鹊传》，通篇多依据蓬鹊山遗闻而作。宋嘉祐初年（1056年），宋仁宗敕封内丘扁鹊祠中奉祀之扁鹊“神应侯”（宋代碑记）。

内丘乃扁鹊文化发祥地，扁鹊文化之乡。扁鹊的活动痕迹在内丘有着完整的链条可以串联起来，其黄老医道之术在扁鹊祠世代传承不断。尤其元代，太医院提点颜天翼（1191-1254年）、颜伯禄父子不但重修扁鹊祠，还将扁鹊祠作为传承中医药的医馆。蓬鹊山也因扁鹊而灵性，与之蓬莱山齐名，曾出现海市蜃楼。

内丘扁鹊祭祀为河北省级非物质文化遗产，不仅为历代朝廷祭祀扁鹊的场所，更是四海民众敬仰扁鹊的圣地。尤其借寒食（清明前后农历三月初一）、寒衣（农历十月一）之气，自古形成盛大无比的传统庙会。辐射到顺德府、保定府、广平府、平乡、南和、任县、邢台、内丘、隆尧、沙河、广宗、曲周、鸡泽、广平等三府十八县。而今波及到河南、山东、山西、陕西、北京等地，会期近一个月，朝拜人数达上百万人次。内丘扁鹊祠现为国家级重点文物保护单位、全国中医药文化宣传教育基地。

由崔隐导演的1985年出品的电影《神医扁鹊》中，葛典玉饰演扁鹊。