电影《神童行动队》主要讲诉了小学校园里有一群乐于助人，喜欢探索的学生，自发的组成了一支少年侦探团，这些“神奇少年”不仅拥有很高的智商，而且各个身怀绝技。

在遇到紧急情况或趋势难测的危险时，他们也能保持相当的镇定，由此可以看出这些把自己装成侦探的小学生也是具有实质能力与相当潜力，是同龄人中的优秀者。寒假到了，这些“神奇少年”被王警官聚集到了一起，共同完成一个神秘的任务。