《福建卫生报》复刊后以推动福建卫生改革，发展卫生事业，提高人民群众的自我保健能力，为两个文明建设服务为宗旨，宣传党和国家关于卫生工作的方针、政策；报道卫生工作的成就和经验；传播医学科学新成果；普及卫生科学知识，提高社会卫生水平；表彰卫生战线好人好事，批评不良倾向，进行卫生舆论监督。《福建卫生报》始终坚持正确的舆论导向，坚持“以优秀的理论武装人，以正确的舆论引导人，以高尚的精神塑造人，以优秀的作品鼓舞人”和“崇尚科学，破除迷信”的办报方针，努力引导广大读者养成文明、科学、健康的生活方式，已成为广大群众爱不释手的专业报。