离子基中的电荷与另一不成对电子可以分别位于分子中的不同原子上,如半醌负离子基（见结构式a）、二苯酮负离子基（b）。个别情况下,可以位于同一原子上。 一般由于离子基与延展的π键发生共轭离域作用（见离域键）而使电子云分散，很难说电荷或不成对电子固定在哪个原子上，因而一般以 c式来表示对－双（二甲胺基）苯正离子基。

有机负离子基比正离子基更为普遍。一般具有延展π共轭体系的有机分子,比较容易接受电子而成为负离子基，它们是电子受体；而相应的另一分子比较容易给出电子，是电子给体，结果成为正离子或正离子基。所以正、负离子基难以单独存在，往往以离子对的形式存在。最典型的例子是芳香族化合物（如芳烃、芳酮等）与活泼金属（如锂、钠、钾等）的反应： 其中钠转移一电子给萘或二苯酮，形成了负离子基的钠盐。这类反应实质上也是氧化还原反应。