福尔马林熏蒸消毒按熏蒸室的体积计算，每立方米用福尔马林（40%甲醛溶液）30毫升、高锰酸钾15克。消毒时在蛋架下方放置一瓷碗，先放入高锰酸钾，再倒入福尔马林，关上门窗，密闭熏蒸20－30分钟，然后取出种蛋，送贮蛋室保存。熏蒸时，室温最好控制在24－27℃，相对湿度75－80%。

新洁尔灭溶液喷雾或浸泡消毒取5%新洁尔灭原液，加5倍40℃的温水，配成0．1%的水溶液，用喷雾器喷洒已放入蛋架的种蛋表面，或把种蛋直接浸泡在0．1%的新洁尔灭溶液中5分钟，取出晾干后送贮蛋室保存或入孵