科学数据库（Scientific database）是中国科学院研制的系统。中国科学院从1978年开始建立，经过中科院几十个研究所、数百名科技工作这近20年的共同努力，已经建成了上百个不同数据类型、不同学科的科学数据库专业子库，形成了一个庞大的、分布式的、异构的数据库群。科学数据库由三个部分组成，包括专业数据库、非专业数据库和科技导航。

专业数据库由微生物资源数据库——微生物菌种、细菌名称、物种编目、经济真菌、国际核酸序列、革兰氏阴性杆菌编码鉴定，动物数据库——脊椎动物分类代码、动物物种编目、濒危和保护动物、昆虫科、动物志，之物数据库——珍稀濒危植物、蜜源植物、红花植物、油脂植物、植物分类名称与代码、纤维植物（棉花）、植物数据库综合检索，水生生物数据库——鱼类、藻类、无脊椎动物、大型水生植物，自然资源数据库——水资源、土地资源、气候资源、生物资源、环境资源、人口资源、工业资源、农业资源，能源数据库——能源—宏观经济、农村能源，地理环境数据库——大气科学与环境、冰冻圈、沼泽（湿地），天文数据库——天文星表，材料数据库——光学材料、高分子材料大气腐蚀、材料在自然环境中的腐蚀，化学化工数据库——工程化学、化学专业、化学危险品安全特性，中医中药数据库——名老中医、中华药膳、中药信息、中药信息（英文版）、中药有效成分、中成药。