来自阿根廷班霸博卡青年的法布里西奥·科洛奇尼早在1999年已被意甲大球会AC米兰相中，但遭博卡青年反对，AC米兰与科洛奇尼的父亲达成协议，时仅17岁的科洛奇尼遵从父命加盟AC米兰，其後国际足协判决AC米兰需补偿给博卡青年。

但加盟AC米兰以来科洛奇尼都是被外借至多家球会。直至2004年他离开AC米兰转投西甲球会拉科鲁尼亚时，仅为球队上阵1次。在拉科鲁尼亚期间，科洛奇尼逐渐成长成为一名出色的中卫指挥官。在西甲渡过4年，于2008年8月转投英超球会纽卡斯尔联，签约5年，转会费可增加到1,030万英镑。

2022年，科洛奇尼选择退役。