秦小文的父亲是新中国食品科学技术和工业发酵与酿造技术的拓荒者和学术带头人、轻工系统对国家有突出贡献专家、无锡轻工业学院（现江南大学）创始人秦含章。秦含章有三个子女，名字起得很有意思：大女儿叫秦小文，二女儿叫秦中文，小儿子叫秦大文，三个子女都相差9岁。