碣石宫遗址，是六处遗址中最大的一处，呈长方形，南北长500多米，东西宽260多米，占地面积15万平方米。

碣石宫建在石碑地高地上。遗址的立体建筑靠海岸线，遗留下来的夯土台高达8米，台基边长40米，有一半沉入地下，是一座规模宏伟的高台多级建筑。

立体建筑的两翼有角楼，后面有成批的建筑群。除秦都咸阳和汉都长安以外，极少有如此大型而又布局有方的宫殿建筑群。从这里出土的特大夔凰纹瓦当和云纹瓦当，是秦代皇家建筑的专用材料，图案的规范化为全国所少见。两千多年前行宫中的大小居室、排水系统、储备食物的窖井等，均清晰可见。遗址处现建有遗址陈列馆。