嘉靖三十一年（1552），充顺天府乡试副主考，明世宗指着他的名字说：“此吾所取状元耶”。

嘉靖三十六年（1557），考满，升任左春坊左谕德。

嘉靖三十七年（1558），升任翰林院侍读学士。

嘉靖三十八年（1559），充廷试读卷官，升任南京国子监祭酒。

嘉靖四十一年（1562），升任太常寺卿，管国子监事。夏，升任礼部右侍郎。

嘉靖四十二年（1563），升任礼部左侍郎。

嘉靖四十四年（1565），充会试知贡举官，录取王锡爵、陈有年、梁梦龙、王一鹗、习孔教等人。

嘉靖四十五年（1566），改任吏部左侍郎兼翰林院学士，总校《永乐大典》，教习庶吉士。言官迎合上意弹劾秦鸣雷，秦鸣雷辞官归乡，修建白云精舍。

隆庆五年（1571），起为南京礼部右侍郎，没有上任，升任南京礼部尚书。

万历元年（1573），致仕。

万历二十一年(1593)，去世，享年76岁。

高祖父：秦世珙

曾祖父：秦宗传

祖父：秦彦彬

伯父：秦文，官至参政。

父：秦礼，官至佥都御史。

叔父：秦祺、秦祹

叔父：秦武，官至监察御史。

堂兄：秦鸣春，曾任刑部侍郎。

堂兄：秦鸣夏，曾任春坊中允。