万历三十八年（1610）进士，授行人，历任礼部主事、户部给事中、礼部给事中、吏部都给事中。升太常少卿，提督四夷馆，参劾罢免大学士方从哲。御史王士英参劾他与赵南星、熊廷弼营私结党，削籍。

崇祯元年（1628），官复大理少卿。历任太仆寺卿、刑部右侍郎、户部左侍郎总督漕运、南京工部尚书。

崇祯十七年（1644），北京失陷，与史可法相约勤王。南明弘光政权建立，加太子太保，与张慎言一起致仕，卒于宣城。

孙：程正萃，字除只，良筹之子。