程淑姿从香港大学物理系取得一级荣誉学士学位，并从香港中文大学物理系取得哲学硕士学位，然后赴美深造，获芝加哥大学物理系颁授哲学博士学位。她在美国加州大学圣地芭芭拉分校的理论物理研究所从事博士后研究工作后便回港，在1995年出任香港中文大学物理系讲师，并于2001年成为教授。

程淑姿也是《湍流期刊》的副编辑。