据考证，立化寺始建于元代大德年间，清代道光年间重修。据日本佛教日莲宗宣德会、大尊会提供的资料证实，1295年，日本僧人日持卜人西渡中国，元大德五年（1301年），到达宣德城（今宣化），后创建立化寺并任住持。

始建后的立化寺，在日持卜人的主持下，曾盛极一时。当时，宣德府名士郑日昌多次拜谒该寺，与日持交往甚密，曾以银盆、瓷器等物赠与日持。日持也曾赋诗回敬日昌。日持传授的“南无妙法莲华经”也颇受众弟子的崇敬。元大德六年（1302年），信女余门李氏曾将“凤凰牡丹刺绣包纱”赠与日持。日持十分珍爱这件赠物，并用它包裹《南无妙法莲华经》的经卷和日莲宗创始人日莲大师的圣像。

1304年，日持圆寂后葬于立化寺塔下。日持是日本日莲宗开宗祖师日莲的六大弟子之一，后被教内弟子尊称为“立化祖师”，他生于1250年，1294年是日莲逝世13周年忌辰，日持为此举行了大法会，朝拜了祖塔，第二年元旦，他以海外弘法为使命，携带日莲圣像，西渡中国开始了《南无妙法莲华经》的传播历程，途经东北、内蒙古等地，辗转7年，到达宣德府（今宣化）。日持出走时书写的《沐决书 立化寺塔》：“更鼓一声新已未，今朝发足出庵门。一天四海难深义，归妙法传孤锡魂。”与在宣德城（今宣化）书写的七言绝句“星霜七岁一眼中，巡锡望涯西又东。鸿雁日啼何处在，愿飞千里故山通。”这两幅真迹和日莲像均在立化寺出土，迄今仍在日本佛教日莲宗宗务院保存。据说，19世纪初，一商人利用去北京送炭之骆驼，把从宣化立化寺塔下出土的文物带到北京，在市场出售。日本人岩田发现这些文物是日本日莲宗高僧日持上人的遗物时，当即收购，并询问了情况。随后岩田专程来宣化作过调查。这些遗物有银盆、文书等，现收藏于日本宣德会。