蜃楼起航前夕，接受秦始皇的紧急军令，带领自己手下的卫队“影密卫”们来到桑海，接班去北抗狼族的蒙恬。

凭借敏锐的洞察力发现并化解了有人（实为赵高的罗网刺客团）要刺杀公子扶苏的阴谋，之后接受扶苏的命令着手彻查此案。同时，察觉到墨家统领盗跖隐匿在远处的大树上，并随后与“影密卫”们追捕盗跖，将盗跖活捉，投入庖丁所在的“噬牙狱”。

李斯、章邯在扶苏面前分析此次事件。与李斯的意见不同，章邯认为此案正是墨家所为。另外，由于在捕捉的现场出现“聚散流沙”组织成员白凤的行踪，章邯、李斯二人认为“流沙”有可能已倒戈相向。二人再度分析，觉得儒家小圣贤庄可能也和墨家有勾结。

盗跖实际上是为找到庖丁下落而故意被章邯缉拿，不料竟被章邯发现其真正意图。章邯将盗跖转到最高级的牢房中严密看守。盖聂、卫庄前来救援和接应盗跖、庖丁。章邯也开始运用“噬牙狱”特殊的机关结构，对四人展开抓捕行动。

随着四人慢慢找到逃离的方法，章邯也渐渐发现了不对劲的情况，随即在“六剑奴”和盖聂、卫庄力战之时前去牢笼之上亲自抓捕。不料监狱中一个曾受到盗跖感化的赵国小兵为了报国情感得以寄托，偷偷打开逃离的开关，于是囚笼随着密道坠落，章邯也同盖聂、卫庄、盗跖、庖丁四人一起下落。下落的秘道内与盖聂，卫庄展开激战，数招后不敌负伤。随众人一起落入海底，发现墨家来接应的机关玄武后，不敌撤退。

因噬牙狱诱捕计划的失败，被扶苏认定要负首责。章邯表示这次计划他还留了一个后手。章邯出去时，遇到赵高，赵高趁机说此次计划的失败的主要责任应该让李斯来负。章邯表现客气，但是态度不置可否，转身告辞。

奉扶苏之命，前去道家晓梦的住处请晓梦前往东郡，正巧碰见晓梦在沐浴。晓梦对于世俗礼节和家国大义有着超然的看法，而章邯则更看重当下，并以帝国万世基业为己任。两人一番意味深长的对话后，还引用了庄子的《逍遥游》。晓梦最后告知章邯知晓此事并离开。

扶苏回咸阳复命前，章邯以向扶苏恳求向皇帝陛下美言为理由，暗中提到了咸阳传来的扶苏要篡夺王位的流言。并有所深意的嘱咐扶苏一路上小心。随即便立即率领影密卫与秦军前往东郡。

晓梦于林中打坐，章邯命令影密卫加强戒备，但还是让道家人宗叛徒木虚子的弟子进入林中趁机偷袭晓梦，但晓梦不费吹灰之力就杀死了他们。章邯前来致歉，晓梦道破章邯放松警戒的真实目的为测试，章邯称不敢，并下令清理打斗痕迹以防外人推敲晓梦的武功，章邯的缜密心思让晓梦微笑夸赞。

章邯到达了东郡，秦国东郡将领白屠前来迎接，因为罗网惊鲵在营中观看荧惑之石残片，白屠故意大声说话而打草惊蛇，而章邯为此有所察觉，待其进入营中惊鲵已消失不见。并召见了押运先锋官钟离眛，了解到反秦势力前来东郡的下落。农家六堂、反秦势力都盯着荧惑之石碎片，章邯说出其中的凶险，让钟离眛多加防备并调查帝国与农家勾结的线索。

章邯让钟离昧带队在落马坡一侧行进，农家蚩尤堂高手骨妖残杀秦军后夺得，神农堂典庆在半路拦截并击退骨妖，典庆和随后赶到的刘邦、司徒万里打开箱子时，箱子突然爆炸，威力惊人，典庆以硬功身躯抵挡并护住了两人，并无大碍。原来章邯在箱子里面放了易爆之物，故意设陷。

章邯让真正的钟离眛带队携带荧惑之石在落马坡另一侧行进，农家烈山堂高手梅三娘拦住队伍与钟离昧单挑，季布趁机抢走箱子。章邯因为受到秦始皇密令和蒙恬肺腑之言的托付，觉得应该查出搅乱农家的幕后黑手，故而一直按兵不动静观其变。后荧惑之石被神农堂朱家所得。

因荧惑之石丢失，章邯下令逮捕白屠，次日处斩。但之后章邯故意让白屠逃狱，并派影密卫跟踪，意图揪出他背后的势力。

深夜，章邯看见影密卫发的信号后，与其他影密卫围堵，发现了卫庄与秦军打扮的罗网杀手惊鲵。并从盖聂口中得知烈山堂主田猛与影密卫实为惊鲵所杀，意识到自己一直追查的搅乱农家、图谋扶苏、刺杀皇帝的幕后黑手就是罗网，而当初在营中的那股极其隐秘的杀气也来自惊鲵，故而拔剑与惊鲵对峙。随后命纵横二人离开。影密卫则与罗网对阵，章邯与惊鲵交手数十回合不分胜负。影密卫杀死罗网成员后与影密卫围堵惊鲵等人，岂料惊鲵派出增援，导致数十名影密卫全部被杀。章邯也在战斗中渐渐不敌惊鲵，受伤不轻。而章邯之前调遣的帝国军队与其他影密卫增援还未赶到，惊鲵正欲杀章邯灭口，却被突然出现的晓梦阻止。惊鲵得知外援到来必生事端，随后逃跑。晓梦见章邯伤的不轻，遂使用内力为其疗伤。章邯询问晓梦是否愿意协助，晓梦没有回答便离开了。这时东郡秦兵到来，章邯命令把牺牲的影密卫带走。

章邯得到消息神农堂主朱家带领大批人马离开，章邯推敲出朱家要去往农家圣地——炎帝六贤冢，接受六大长老的任命，出发带人前往。

章邯来到大泽山炎帝六贤冢山门前。命令影密卫在炎帝六贤冢设下陷阱和埋伏，成功杀死三名罗网地字级杀手并抓住惊鲵。但遭遇到螳螂捕蝉，蜘蛛在后的局势，影密卫被罗网天字一等杀手掩日轻易击杀。章邯也被惊鲵与掩日联手重创，后利用机关逃脱躲避被韩信与钟离眛所救。并得知前任侠魁田光失踪于大泽山的情报。为了应对罗网的阴谋，章邯决定联合鬼谷纵横。后在纵横的藏身处审问白屠。从孟姜的话语中得出结论“扶苏立”三字原本是不存在的，是惊鲵刻意刻上去的，原本荧惑之石上的字是“始皇帝死而地分”七个。在审问白屠时得知屠杀东郡百姓是为了把可能见过荧惑之石的人全部灭口，而传达给白屠这一命令的是上将军王离。

被王离邀请入醉梦楼，在王离离去后，章邯被软禁，并与突然出现的掩日对峙。

因章邯身中千蛛噬梦，故两人短暂交手后，章邯全身出现了融化的状态，遂不敌掩日被打倒在地。章邯欲让掩日揭开面具，却遭掩日戏耍。后章邯主动让掩日将剑刺入自己心脏，终于摆脱了梦境，但其也因此七窍流血，奄奄一息。掩日正欲对章邯下手，纵横及时赶到，与掩日展开交锋。章邯则被韩信等人从密道救走。

章邯并未插手农家与百战穿甲兵的连番大战，在王离军大败后，章邯率领影密卫前来帮助王离军脱险。在王离因掩日的挑拨心生歹念时，章邯及时出言规劝，暂时使王离放弃了不忠不智之举。

动画

动画第五部

官方铝合金挂画评价：秦军大将 秘隐之鬼 如蛆附骨 如影随行

动画第5部第2集评价：草蛇灰线 千里追踪 如蛆附骨 如影随形（第3集中再度改为“行”）

卫庄评价：我觉得他不像是在看戏，而像在钓鱼。（第五部40集）

惊鲵评价：章邯，没想到你对付同僚的手段竟如此狠辣，真让我感动（第五部49集）。不愧是帝国的忠臣良将，应当青史留名。（第五部58集）