成化十五年（1479），升任太常寺卿，仍然掌管钦天监。

成化十九年（1483），因疾致仕。

弘治元年（1488），钦天监因不称职被罢官，童轩再次掌管钦天监。进都察院右副都御史，奉敕提督松潘军务，兼理巡抚。

弘治四年（1491），升任南京吏部右侍郎。

弘治六年（1493），请求致仕，不许。

弘治七年（1494），升任南京礼部尚书。

弘治十一年（1498）二月十九日，病逝，赠太子少保。

《清风亭藁》、《枕肱集》、《海岳涓埃》、《谕蜀藁》、《筹边录》、《梦徵录》。

曾祖父：童元恺

祖父：童金友

父：童碧瑄，号玉壶，精通天官学。永乐初年，召入钦天监，充天文生。后命入文渊阁，纂修天文诸书，安家南京秦淮河之西。

仲兄：童惠，继承父业。

妻：陈氏

侧室：李氏、蔡氏

子：童紫芝

侄子：童霛

女：童静娥，嫁锦衣舍人黄璋。

侄孙：童应祯

倪岳：质清气粹，平居癯然，若不胜衣，而强学好问，至老不倦。