在初号机拒绝启动傀儡系统的情况下，NERV依靠零号机与二号机对抗第十四使徒。二号机的攻击全然无法中和第十四使徒的AT力场。二号机随后被瞬间击败了，其手部和头部都被切掉了。零号机虽然手部还未再生，但是却勉强出战，想和第十四使徒同归于尽，却因为第十四使徒的核心有外壳保护，攻击全然无效，只侵蚀了第十四使徒的AT力场。第十四使徒直接攻入了NERV的中枢的作战指挥部，却在危机时刻被初号机迎头痛击。初号机虽然未能消灭第十四使徒便将能源耗尽了，但是却在危机时刻觉醒了。在400%的同步率下，初号机以难以想象的作战方式虐杀第十四使徒并将其吞噬了，而初号机身上的束缚装置也因此被破坏了。初号机通过吞噬的手段得到了第十四使徒的动力来源S2机关。（第19集）