1945年9月，根据中共中央关于向东北发展，并争取控制东北的战略部署，驻延安的炮兵学校1000余人进入东北。1946年3月，以该校工兵科为基础在吉林省通化市扩编为东北民主联军工兵学校。4月，炮兵学校移驻黑龙江省牡丹江地区，收集、修复日伪军遗留的残损火炮和战车，组建了3个炮兵团和1个高射炮大队、1个战车队。5月，东北民主联军总部成立炮兵调整处。7月，炮兵学校改称东北民主联军炮兵学校。10月，以炮兵调整处为基础，并从炮兵学校抽调部分干部，在哈尔滨组建东北民主联军炮兵司令部，朱瑞任司令员，邱创成任政治委员，贾陶任副司令员（后苏进），匡裕民任副司令员兼参谋长，刘登瀛任政治部主任。下辖10个炮兵团和1个高炮大队、1个坦克队。炮司所属各部队参加三下江南四保临江作战及东北1947年夏、秋、冬季攻势作战。1948年1月，改称东北人民解放军炮兵司令部。8月，为便于炮兵部队的教育训练和作战指挥，以炮兵司令部前方临时指挥机构和炮兵部队组成炮兵纵队，归炮兵司令部建制，苏进兼任司令员，邱创成兼任政治委员，后吴涛任政治部主任。9～10月，炮兵、工兵和战车部队参加辽沈战役，主要用于锦州方向，封锁国民党军飞机场，切断其空中运输，击毁飞机15架，并直接配合步兵攻坚，给予攻锦部队以有力支援。10月，朱瑞在义县战斗中牺牲，中共中央军委批准将东北炮兵学校命名为朱瑞炮兵学校。11月，以工兵学校一部编成东北人民解放军工兵指挥所。12月，炮兵司令部和炮兵纵队领导机关合编为东北野战军特种兵司令部，萧华任司令员，钟赤兵任政治委员，苏进任副司令员兼参谋长，匡裕民、贾陶任副司令员，邱创成任副政治委员，唐凯任政治部主任。下辖由冀察热辽军区炮兵旅旅部及其直属队组成的炮兵第1指挥所和所属3个骡马炮团；由辽北军区机关、冀察热辽军区炮兵旅第1团团直组成的炮兵第2指挥所和所属3个重炮团；由松江军区前方指挥所组成的装甲兵指挥所和所属坦克团、装甲车团、坦克教导团；高射炮兵指挥所和所属3个高炮团；工兵指挥所和所属2个工兵团；朱瑞炮兵学校等，总计3.7万余人。特种兵司令部成立后，除将炮兵学校留归东北军区外，其余机关、部队随野战军进山海关作战。在平津战役中，以所属炮兵、高射炮兵、装甲兵、工兵部队集中使用于天津方向，配合步兵攻坚作战取得胜利。1949年2月，炮兵第2指挥所和装甲兵指挥所及所属部队参加和平解放北平（今北京） 的入城式。2～3月，执行对国民党军第94军军部以及1个战车团、1个工兵团和1个装甲炮兵营的改编任务。