《伤寒论》是东汉张仲景集前人医学成果和自己几十年行医经验而创作的一部医学巨著。它奠定了中医辨证论治的基础。由于《伤寒论》成书于东汉、三国的混乱时期，原书已散佚不全。后来经晋朝大医学家王叔和整理编次成书，成为《伤寒论》的唯一传本．历代医家奉为室典，少有疑义。

方有执在深入钻研《伤寒论》的基础上。通过多方博访，广益见闻，搜集大量材料，经过深思熟虑，对王叔和编次的《伤寒论》提出自己的见解，认为王氏传本《伤寒论》文字简古，并且互相抵触，只述伤寒，不涉及杂病，编次欠妥，而篇章节臼，时有伪托，非张仲景本意。提出要正确地研究《伤寒论》，必须按张仲景的原意，对此书重新进行整理和编订，达到“小仲景之心，志仲景之志，以求合平仲鲁之道”。为此，他呕心沥血20年，完成了《伤寒论条辨》一书。对王叔和编次的《伤寒论》进行重订，大倡“三纲鼎立”之说，开创了研究《伤寒论》的新趋向。首先赞成的有江西人喻昌，认为方有执“卓见独识，前古未有”。