在农艺系肄业期间，管相恒对日本帝国主义将中国培育的粳稻立名为日本稻型，将中国籼稻定名为印度型，十分气愤，立志要为提高我国稻作科学技术和生产水平奋斗终生。毕业后，复受邓锡侯的资助去日本东京帝国大学农学部深造。学成归国，任四川省农业改进所技正，兼四川省大学农学院、华西大学农学系、金陵大学农学院教授。盛夏一天中午，省建设厅长卢作孚便服来到农改所，行至稻改良场，见水稻盆钵之间，一人大汗淋漓，专心致虑地工作，卢误为工人，询及，乃知为留学归来的技正，卢深为敬佩。问何所需？管答，急需一温室。次日，建设厅拨来建设温室专款，管相桓主持全川水稻品种的收集、普查和鉴定工作，选出了适合四川各地自然生态区的高产品种。

民国34年，管相桓受美国加利福尼亚大学之聘，欲乘赴美之机去菲律宾、印度考察。由于生活费用高，省府补助的经费有限，乃于12月29日，致函营山县临时参议会，仰望家乡资助法币160万元。县临参会却以“本县财政奇绌，力有不足，复请鉴谅”之词拒绝，引起舆论谴责，才被追拨款100万元，但时过境迁，法币贬值，于事无补了。民国38年，管相桓放弃美国的高薪待遇，9月26日从美国回到成都。1950年参加创办西南农学院，主持教务及农学系的工作，从事基因遗传学的研究。1951年被选为重庆市人民代表。当时、我国主张学习苏联一边倒，而苏联农学家李森科是反对基因学的，管相桓研究的基因遗传学也就被打人“冷宫”。在1957年的反右斗争中，管相桓被划为“右派分子”，1961年才作摘帽处理。1966年病逝于重庆。