2009年7月2日，西甲瓦伦西亚俱乐部官方宣布从马洛卡队签下门将米格尔·莫亚，合同为期四年。

25岁的莫亚已经通过了瓦伦西亚的体检。西班牙媒体透露，瓦伦西亚为莫亚支付的转会费是500万欧元，此外视出场时间和表现可以上浮100万，这个价格也创下了瓦伦西亚历史上引进门将的身价记录。

北京时间2013年4月，巴萨已经与其经纪人基隆进行过联系，基隆宣称红蓝军团只需要支付600万欧元就能得到莫亚。

离开瓦伦西亚后，莫亚曾效力于赫塔费以及马德里竞技。

2018年，莫亚加盟皇家社会，并在2020年8月于球队续约至2021年。