紫萁目的叶子通常呈现丛生状状，羽毛状的排列，繁衍用的孢子密生于叶脊。紫萁目比其他大多数的蕨类要来得大。

萁目里的蕨类会形成厚重的根茎，并带有茂密的坚韧根部。许多物种会形成短树干，但只有高约8厘米至10厘米而已；如在“块茎蕨属”中，即有时会因为其树干被认为是树蕨，虽然它们相对较短。

其叶组织由如假紫萁非常粗糙、几乎像是皮革般，到如薄膜蕨属易脆且透明的都有。