约翰·沃利斯的父亲是Ashford的名人，很受尊敬。可惜他在沃利斯六岁时便逝世。1625年他进入James Movat's grammar school。学校没有教授数学。1631年的圣诞假期，沃利斯的兄长教他算术，沃利斯首次和数学接触，数学从此成为了其爱好。1632年他进入剑桥大学伊曼纽尔学院。当时没有人能指引他的数学学习，他便读了很多不同的课程，包括伦理学、形而上学、地理、天文、医学和解剖学。他曾辩倒其老师Francis Glisson的血液循环革命理论。 1637年获文学士学位。1640年获硕士学位。1644年成为西敏神职人员的秘书。 他写了不少宗教文章、一本关于神秘学的书、语法书Grammatica linguae Anglicanae（牛津，1653年）和逻辑学书籍Institutio logicae （牛津，1687年）。