缨子木科的学名Crossosomataceae由模式属缨子木属学名Crossosoma的复合形式Crossosomat-加上表示科的等级后缀-aceae构成。该词为复数形式，故在做主语时应与动词的复数形式搭配。

本科中文名亦由模式属中文名“缨子木属”中的专名“缨子木”加上“科”字构成。因为“缨子”意为“种子具流苏状（缨状）毛”，故其中的“子”字不读轻声。本科单纯的中文别名有流苏亮籽科、流苏子科、穗籽木科、繸体木科、燧体木科等，详见缨子木属条目的“词源”一节。