1998年5月，“深港罗湖、福田/落马洲口岸旅客过境轨道接驳工程”项目建议书获批，并更名为“深圳地铁一期工程”，罗湖站工程立项。

1999年4月，国家批准《深圳地铁一期工程可行性研究报告》，同时批准深圳地铁开工建设，罗湖站建设规划获批。

2001年3月，深圳地铁罗湖站开始施工。

2002年5月6日，罗湖站主体结构工程全面开工建设。

2004年12月28日，罗湖站随深圳地铁一期工程的开通投入使用。

2005年2月8日，深圳罗湖口岸与深圳地铁罗湖站实现无缝对接。