批评者提到，在该法案的规定中，被建立的国家情报总监的权力太小了，以致于不能够适当地去领导、管理与改进美国情报体系的效能。

特别是，该法案让美国国防部，可以管理美国国家安全局、美国国家侦察局与美国国家地理空间情报局。

2005年2月17日，美国总统乔治·沃克·布什，任命美国驻伊拉克大使约翰·内格罗蓬特，担任这个职务，并等待参议院的确认。报道指出，布什总统的国家情报总监第一人选，是前中央情报总监，现在担任德州农工大学校长的罗伯特·盖茨，然而他拒绝了这项职务。参议院于2005年4月21日，以98比2的票数，通过内格罗蓬特的任命案，并在同一天，于布什总统的监礼下宣誓就职。

2007年2月13日，内格罗蓬特宣誓成为美国常务副国务卿，而约翰·麦可·麦康奈尔，成为第二届的国家情报总监。

2009年1月29日-2010年5月，前美军太平洋司令部司令丹尼斯·布莱尔，任第三届国家情报总监。

2010年6月5日，美国总统奥巴马，提名国防部副部长詹姆斯·克拉珀，为新任国家情报总监。

2017年3月16日，美国国会参议院压倒性的确认，前联邦参议员丹·科茨，为特朗普政府的国家情报总监。

2020年2月28日，美国总统特朗普宣布提名国会众议员约翰·拉特克利夫（John Ratcliffe）出任国家情报总监。

当地时间2021年1月20日下午，美国参议院以84票支持、10票反对的投票结果确认了艾薇儿·海恩斯（Avril Haines）担任美国国家情报总监。

2004年，情报改革和防恐法案规定，国家情报总监办公室是美国联邦政府独立行政机构，来协助国家情报总监。给予国家情报总监办公室与美国情报体系的预算，都是机密。

国家情报总监办公室，大约有1,500名雇员。美国国家反恐怖主义中心，是国家情报总监办公室之中，最大的组织。

2007年3月23日，国家情报总监约翰·麦可·麦康奈尔宣布组织的变更，这包括：

1.增加一个副国家情报总监的职位；

2.增加情报政策规划与需求主管，取代情报需求主管的职位；

3.建立执行委员会；

4.指定参谋长的职位成为情报参谋长。

情报参谋长办公室，负责协调并统整，国家情报总监办公室各幕僚与各机构的成果。

在情报参谋长下面，有这些机关：

1.执行秘书与执行秘书处

2.法务处与其处长

3.公关处与其处长

4.监督处与其处长

5.礼仪处与其处长

6.警戒处与其处长

情报搜集主管办公室，是负责透过在国家情报总监之下，情报体系协调搜集情报的事宜，并且确保美国国家情报战略重点，可以适当地反映出，未来计划与系统取得的决定。

情报搜集主管办公室，必须清楚整个完整的情报搜集事务，且必须有对于发展共同对于需求与确保过去的经验，能被用在现在和未来的情报搜集系统方面的了解。情报搜集主管，使情报体系的利益关系人们，得到对于这些议题的高层情报。

情报搜集主管，有4个助理主管协助他/她：

1.搜集战略助理主管

2.人类情报助理主管

3.开放资源助理主管

4.技术方法助理主管

情报分析活动的基础单位，则仰赖情报分析主管,，同时，也是国家情报委员会的主席。

2007年3月时，有六个情报分析助理主管：

1.国家情报委员会情报分析助理主管，同时，也是国家情报委员会的副主席

2.总统每日简报情报分析助理主管

3.分析任务管理情报分析助理主管

4.正确与标准分析情报分析助理主管，也被称作分析调查专员

5.分析转换与科技情报分析助理主管，也被称作首席技术长

6.体系支援情报分析助理主管

国家情报总监办公室主管

2021年6月25日，美国国家情报总监办公室向国会提交一份报告，包含2004年以来的144个被美国政府正式称为“不明空中现象”的事件，但该报告没有就诸多关键问题给出明确答案。