陆军工程师团是负责防洪工程建设与管理的主要部门，而垦务局则负责以灌溉、供水为主的水利工程的建设与管理。联邦政府修建防洪水利工程的建设程序是：首先由地方、州政府或受洪水威胁及发生洪水灾害的地区（或社区）提出请求，然后由陆军工程师团负责考察评估和可行性论证，并负责确定工程建设方案，提交总统和国会，由国会批准后纳入国家财政预算，予以实施。

在美国，防洪抢险工作原则上以地方政府为主，堤防、水库及其它水利工程的抢险工作由地方政府组织工程技术人员及工程保护范围内的志愿人员（居民）来进行。陆军工程师团在抢险加固工作中主要是为当地提供技术指导。对于重要堤防、河段，陆军工程师团和地方政府共同协商处理险情，由双方人员共同组成防洪专家组，分区、分段负责巡回检查，每年一般检查两次以上，发现险情及时协调处理，所需经费和物资由地方政府负责解决。在工作配合上，双方密切合作，相互尊重，分工明确，各负其责；在技术问题上共同讨论研究解决，如有意见分歧，则以陆军工程师团的意见为准。