美扭椎龙亚科是兽脚亚目坚尾龙类斑龙科里的一个亚科，以前传统的错误分类常把该亚科并入斑龙亚科，但1988年的研究表明该亚科成员骨骼上的独立特征和生理构造，与斑龙亚科有着明显的区别和差异，同时也与非洲猎龙亚科骨骼的差异和区别也很显著，故此单独建立了该亚科。

美扭椎龙亚科以前曾经包含大龙属和美扭椎龙属、扭椎龙属，总共三个属，但在2010年的细致研究中，发现大龙和非洲猎龙、乐山龙的亲缘关系更接近，离该亚科的模式属（美扭椎龙属）的亲缘关系较远，所以被分入了非洲猎龙亚科。而扭椎龙经过重新研究发现不属于美扭椎龙亚科甚至斑龙科，故被分出斑龙科归入斑龙超科（但哪一科存在争议）。因此，该亚科仅剩下了美扭椎龙属一属。