对考古遗址里出土的植物遗存进行分析和研究的学科。它是由考古学与古植物学相结合而发展起来的一门边缘科学。考古植物学与古植物学有关系，但是二者研究的侧重点不同。古植物学侧重于植物的发生、发展和系统分类的研究，植物遗存不论是否采自与人类共存的遗址内的层位，都可作为研究的对象。而考古植物学是按照考古学的要求，对考古遗址里出土的、与古代人类活动有关系的植物遗存进行研究，揭示古代人们对植物食物的选择，栽培植物的起源，早期农业的出现等经济生活与文化生活的概况，以及居址周围的自然条件与生态环境。

考古植物学研究植物遗存的手段有：孢子花粉分析，以及新发展起来的“浮选法”、“灰像法”和“碳－13((C)测定”等方法。通过对考古遗址中的古代苔藓、蕨类植物的孢子和种子植物的花粉遗存的分析，可以了解当地古气候、古地理的变化以划分时代，对石器时代的断代有重要意义；还可以复原古代人们的生活环境及其文化发展,例如根据文化层中农作物花粉的显著增加,可以说明当地居民栽培植物经济的增长。将花粉分析应用于考古学已有三、四十年的历史，但是从考古遗址的文化层中取得大量植物遗存样品提供分析研究，还是在有了浮选法以后才得以实现的。