1998年，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T1航站楼启用。

2001年5月，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T4航站楼启用。

2007年，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T8航站楼启用。

2008年，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场首次起降由空客A380执飞的定期航班，T5航站楼启用。

2012年，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T4航站楼成为机场首座满足出租车在室内搭载旅客的航站楼。

2013年5月，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T4航站楼改扩建工程启用，面积扩大了4.57万平方米。

2015年，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T4航站楼B区二期启用。

2017年，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T4航站楼成为美国第一座认证LEED金级的航站楼。

约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场位于美利坚合众国纽约州纽约市皇后区。

截至2021年3月，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场共有6座在运营的航站楼，分别为T1、T2、T4、T5、T7和T8航站楼（T3和T6航站楼分别于2013年和2011年拆除）；共设有128个登机口。

约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T1航站楼于1998年投入使用，由法国航空、日本航空、大韩航空、汉莎航空联合出资修建和运营管理，供上述四家航空公司及其合作伙伴使用。T1航站楼设有11个登机口，主体结构为四层，可保障空客A380型客机。

约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T2航站楼于1962年投入使用，由达美航空运营和管理，为达美航空国内航线专用航站楼。T2航站楼设有7个登机口，主体结构为两层。

约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T4于航站楼于2013年投入使用，由史基浦皇家集团子公司运营管理，主要供国际航班使用。T4航站楼建筑面积13.9万平方米，有2个指廊，设有38个登机口，主体结构为三层，可支持A380型飞机停靠。

约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T5航站楼于1962年投入使用，主要供捷蓝航空使用。T5航站楼设31个登机口，主体结构为两层。

约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T7航站楼于二十世纪七十年代建造并投入使用，供英国航空及其合作伙伴使用。T7航站楼设12个登机口，主体结构为三层。

约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T8航站楼于2007年8月投入使用，主要供美国航空及其寰宇一家合作伙伴使用。T8航站楼设84个人工柜台、44台自助服务柜台、10个安检通道、29个登机口，主体结构为两层，可满足每小时旅客吞吐量1600人次、年旅客吞吐量1280万人次的使用需求。

约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场是美国航空、达美航空的枢纽机场，也是捷蓝航空、挪威航空的基地机场。据2020年12月机场官网显示，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场共有71家航司在此开通180条航线，共通航77个国家和地区的169座城市，涉及176座机场。

据2020年12月中国东方航空官网显示，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场人工值机柜台在国际航班预计起飞前60分钟停止办理乘机手续。

据2021年3月机场官网显示，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场场内设轻轨列车往返于各航站楼。其中，航站楼、停车场、汽车租赁中心之间摆渡不收取费用，从机场前往铁路车站票价为7.75美元/人次。

据2021年3月机场官网显示，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场临近牙买加站，旅客可在此换乘长岛铁路（LIRR）列车前往曼哈顿、布鲁克林、长岛等地。

据2021年3月机场官网显示，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场设有2条免费接驳巴士线路前往拉瓜迪亚机场，除T2航站楼外其他航站楼均设有乘车点，发车间隔为10至15分钟。

据2021年3月机场官网显示，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场共设有5个停车区，其中T1、T2航站楼共用绿色区停车场，T4航站楼附近设蓝色区停车场，T5航站楼附近设黄色区停车场，T7航站楼附近设橙色区停车场，T8航站楼附近设红色区停车场。

根据机场总体规划，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场T1、T2和T7航站楼将进行整体设施改扩建，T4、T5和T8航站楼将进行登机口及廊桥的扩建，且采用与私有企业合作的方式进行。

预计到2030年，约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场可满足年旅客吞吐量7500万人次的使用需求。

约翰·菲茨杰拉德·肯尼迪国际机场直接为当地提供28万个工作岗位，每年为当地创造510亿美元的生产总值。

当地时间2024年7月24日8时15分左右，位于美国纽约的肯尼迪国际机场8号航站楼因自动扶梯起火导致短暂疏散，事件造成9人受伤，多架航班取消。该航站楼于当天恢复运营。截至2024年7月25日，火灾原因正在调查中。