胚由胚芽(plumule)、胚轴(|lypocotyl)、胚根(radicle)和子叶(cotyledon)四部分组成。胚芽是处于幼态的茎枝，由茎的顶端分生组织及其产生的幼叶组成，其下通过胚轴与胚根相连。胚轴是连接胚芽与胚根的柱状结构，子叶着生于其上靠近胚芽的一侧。位于子叶和胚芽之间的胚轴部分称为上胚轴(epieotyl)，而子叶和胚根之间的部分则称为下胚轴(radiclehypocotyl)。很多种子在萌发时下胚轴首先显着伸长，例如日常生活中常吃的豆芽，其可食部分主要是显着伸长的下胚轴。胚根位于胚轴的下端，由根的顶端分生组织与根冠组成，以后将发育成植物的主根。胚根的先端一般正对着种孔，有利于在萌发时吸收水分。子叶是贮藏或吸收转运养料的叶状结构，可为萌发初期的种子提供营养支持。双子叶植物具有2枚子叶，单子叶植物具1枚子叶，而裸子植物则常具有多枚子叶。禾本科单子叶植物如小麦、玉米、水稻的子叶特化为盾片(scutellum)；其胚芽外方包被有鞘状结构称为胚芽鞘(coleoptile)，胚根外方包被有胚根鞘(coleorhiza)。