胡亚安致力于内河水运通航建筑物的前沿技术攻关、核心装备研发和重大工程实践，是交通运输部“高坝通航建筑物建设技术创新团队”总负责人。在船闸工程研究领域，建立了非恒定流减压试验理论和方法，研发了世界唯一的超大型非恒定流减压试验装备，创建了阀门分级防空化技术体系，攻克了高水头阀门空化难题；研发的阀门安全保障成套技术和高通过能力船闸输水系统，突破了超高水头船闸安全高效输水技术瓶颈。在升船机工程研究领域，发展了升船机水动力安全控制理论，研发了大尺度升船机整体动态试验平台，创新了升船机多元耦合稳定控制技术，建立了多因素通航安全综合评价体系；作为科研负责人，通过产学研相结合，与团队共同发明了一种利用水能作为提升动力的新型升船机——水力式升船机，引领了升船机创新技术发展。承担了中国绝大多数高水头大型通航建筑物科学研究工作，解决了三峡、葛洲坝、大化、乐滩、草街、银盘、桥巩、长洲、大藤峡等高水头船闸，以及景洪、思林、沙陀、构皮滩、向家坝、三峡等大型升船机工程水动力安全关键技术难题。