自墨西哥独立后，英国、美国、法国等列强相继侵入。它们通过贷款，输入商品，投资以及签订不平等条约，逐步控制了墨西哥的经济和政治，使墨西哥走上了半殖民地、半封建化的道路。在严重的民族危机面前，执政的保守派军事独裁政权屈膝媚外，使国内各种矛盾愈发尖锐。

1847年，保守派政府因美墨战争失败被迫下台。温和派首领何塞·华金·德·埃雷拉和马里亚诺·阿里斯塔相继担任总统，采取了恢复联邦主义原则，举行地方选举等一些改良措施。自由派通过选举取得了一些州的执政权。胡亚雷斯正是在此时期担任瓦哈卡州州长，并积极地争取实行改革。

1852年，保守派得势，安东尼奥·洛佩斯·德·圣安纳开始了独裁统治。胡亚雷斯辞去州长职务，重操律师旧业，任艺术和文理学院院长兼民法教授。圣安纳上台后，变本加厉地实行独裁统治，倒行逆施，激起了全国人民的反抗。由于反对圣安纳，华雷斯遭到迫害，于1853年遭到绑架。先被关押在一个孤岛上，后流放到国外。

1854年3月1日，自由派印第安人将军胡安·阿尔瓦雷斯在他执政的盖雷罗州阿尤特拉城宣布起义，号召推翻圣安纳的独裁统治，在墨西哥建立民主政府，史称“阿尤特拉宣言”（又称“阿尤特拉计划”）。起义者自称“复兴自由军”。参加起义部队的主要有印第安村社农民和一些城镇居民。阿尔瓦雷斯率领起义军同圣安纳的政府军激战近21个月。华雷斯闻讯后，也回到墨西哥，担任阿尔瓦雷斯将军的政治顾问。起义者以弱胜强，打败了保守派政府的9万正规军。1855年8月，圣安纳的独裁政权被推翻。

同年10月初，阿尔瓦雷斯被选为临时总统，组成了自由派领导的临时政府，胡亚雷斯任司法、教会事务和国民教育部长。自由派执政后，立即实行民主改革。其中，华雷斯主持进行了司法改革和举行制宪议会的选举。他于11月23日制定了废除教会与军官特权的《关于中央和地方各级法院组织和司法管理的法令》（史称《华雷斯法》）。它规定废除天主教会和军队特设的法庭，取消教士和军人不受普通法院审判的特权，宣布在法律面前人人平等的原则。这是革新运动打击封建势力政治特权的第一个革命措施，是确立资产阶级法权的重要步骤。

但他的激进立场为保守派—教权集团以及自由派中的温和派所不容。首都大主教德·拉·加尔萨-伊-巴耶斯特罗宣称将把服从华雷斯法的人开除出教。参加政府的温和派也企图阻挠自由派的改革。瓜那华托州州长多夫拉多在伊格纳西奥·科蒙福特的支持下于12月上旬发动政变，迫使阿尔瓦雷斯和外交部长奥坎波辞职。

由于受到保守派的威胁，科蒙福特在接任临时总统后不得不同自由派保持合作。1855年12月便被撤出内阁，重任瓦哈卡州州长。在自由派的积极推动下，1856年初，临时政府制宪议会开幕，议会批准了华雷斯法，并通过禁止强迫征收什一税、驱逐耶稣会等法令。

1856年1月至1857年10月，胡亚雷斯回瓦哈卡州组织新的州政府。他在任内整顿财政和司法管理，批准州的民法典和刑法典；修改州宪法，规定州长普选制；改进国民教育，恢复被保守派取消的科学与艺术学院。他还平定了州内保守派的叛乱。

主词条：三年改革战争

1857年2月5日，制宪议会通过并宣布了在当时具有重大进步意义的墨西哥新宪法。在9月的地方选举中，华雷斯在总票数112541票中获100336票，以绝对多数当选为瓦哈卡州州长。11月初，他回首都改任内政部长。11月根据新宪法举行大选，科蒙福特当选为总统，胡亚雷斯当选为最高法院院长，即法定的副总统。自由派人士在新选出的国会中占大多数。反动势力公开宣称反对新宪法，发动武装叛乱。温和派则攻击改革破坏了“和平与秩序”，反对加强议会民主和限制总统权力。科蒙福特要求修改宪法，遭到自由派的拒绝。保守派乘机策动政变，于1858年初推翻科蒙福特政府，建立以保守派将军费利克斯·马里亚·苏洛亚加为首的反革命政权，挑起了内战。

在保守派政变时，华雷斯和许多自由派议员曾一度被捕，释放后旋即离开首都。1858年初，科蒙福特逃亡美国。1月19日，聚集在克雷塔罗城的70名国会议员举行会议，根据1857年宪法拥戴华雷斯为共和国临时总统，组成新的联邦政府。华雷斯政府坚决维护1857年宪法，捍卫改革成果，得到南北大多数州的拥护。全国形成以自由派为首的保卫宪法同盟，温和派人士和一些地方势力也参加进来。当时支持伪政权的美、英两国外交使节认为十分之七、八的人民都拥护华雷斯政府。

起初，保守派军队在战场上采取攻势，迫使华雷斯政府一再转移，1858年5月迁至东部海岸的韦腊克鲁斯。1858年下半年和1859年，内战处于相持阶段，主要战场在瓜那华托、哈利斯科、圣路易斯波托西等州。1859年初，保守派将领米格尔·米拉蒙继任伪政权首脑，于同年2月率领主力部队进攻韦腊克鲁斯。自由派政府军乘虚攻打墨西哥城，并攻占中部一些城市，迫使米拉蒙撤回首都。

鉴于欧美列强同伪政权保持外交关系，华雷斯政府严正声明伪政权无权代表墨西哥，并照会各国使节应与伪政权断绝关系而同合法的自由派政府建交。美国政府出于自身利益的考虑，迟至1859年4月才承认华雷斯政府，并派罗伯特·麦克伦为常驻外交代表。同年12月，为了获得军火供应，华雷斯政府同美国签订了不平等的《奥坎波—麦克伦条约》，赋予美国永久享有货物免税通过墨西哥西北地区和南部特万特佩克地峡以及派驻美军的权利。该条约由于双方国会均未批准而作废。

为了动员人民打击敌人，华雷斯政府果断地采取重大的改革措施，颁布了一系列著名的改革法。1859年7月12日，根据外交和内政部长奥坎波、国防部长兼共和国武装部队总司令德戈亚多等人的建议并由莱多拟定，公布《墨西哥社会改革宣言》，宣布保守派—教权集团是内战的罪魁祸首；无偿没收除教堂建筑物以外的教会全部土地财产；把收归国有的教会地产分成小块出售给农民，在5至9年内分期付清价款；实行政教分离和信教自由，取消什一税和教会其他捐税，封闭男修道院等。7月23日，公布实行世俗婚姻和将户籍登记移交国家机构办理的法令。7月31日、8月11日颁布的法令规定：出版自由，教会负责赔偿内战对国家造成的物质损失，改革国民教育制度，封闭女修道院，取消教会管理墓地和主持公众节日的权利等。同时停止了《莱多法》中侵犯印第安村社土地的作法，承认村社土地公有制合法。改善了政府同印第安农民的关系。

改革法的实施，有力地打击了保守派—教权集团的势力，对内战的结局起了决定性的作用，保证了自由派的胜利。到1860年夏，内战形势发生根本转折，自由派发动强大攻势，由阿尔瓦雷斯等组织三路大军向首都推进，于同年12月25日解放墨西哥城。1861年1月11日，华雷斯政府胜利迁回墨西哥城，保守派政权彻底垮台。支持伪政权的罗马教皇使节、墨西哥大主教、4名主教以及西班牙使节被驱逐出境。

主词条：墨西哥反英法西战争

1861年6月，华雷斯当选为墨西哥共和国总统。此时，华雷斯面临着由因战争破坏而造成的严重困难：保守派残余势力继续作乱，在大选中杀害了奥坎波、德戈亚多等自由派领导人；墨西哥政府财政赤字达5百万比索，外债利息的支付即占国家预算的1/4。7月17日，华雷斯宣布停止偿付外债两年。支持墨西哥保守派的债权国英国，法国和西班牙便借此为口实，决定实行它们早已策划的干涉。10月31日，英、法、西三国代表在伦敦签订协定，决定共同出兵干涉墨西哥。

1861年12月，西班牙从古巴派出6000人的军队攻占了韦腊克鲁斯。1862年1月，英军700人、法军2000人先后在墨西哥登陆。2月，墨西哥与英法、西代表在拉索莱达举行谈判，以解决三国对墨西哥的要求。4月，英、西撤军。但法国皇帝拿破仑三世坚持侵略政策，于4月16日悍然对墨西哥宣战，进一步增兵至6500人。流亡国外的反动分子在法军的庇护下纷纷回国实行复辟，组织起以保守派将军胡安·内波穆切诺·阿尔蒙特为首的傀儡政权。

列强的干涉和侵略激发了墨西哥人民的民族意识和爱国主义精神，他们积极支持华雷斯政府组织全民抗战。华雷斯在三国干涉开始时即发表告全国人民书，号召全民族团结和行动起来，保卫“人民自己最伟大和最神圣的祖国”。同时，授权各州州长组织游击队，动员人民抗战，并下令严惩一切卖国贼和外国间谍。

华雷斯任命I.萨拉戈萨将军指挥墨西哥军队保卫通向首都的大城普埃布拉，抵抗法军进攻。1862年5月5日，墨西哥军队打死打伤法军千余人，迫使法军退守奥里萨巴（普埃布拉保卫战）。7月，拿破仑三世任命E.F.福雷为远征军司令，侵略军猛增至34000人。

1863年3月，法军以比墨西哥军队多一倍的兵力再攻普埃布拉，遭到激烈抵抗，最后以伤亡4000名士兵的代价占领该城。5月31日，华雷斯政府撤出首都，向北转移，迁至圣路易斯波托西。6月10日法军侵入墨西哥城。7月，法军在墨西哥城召开大地主、高级教士和高级官员参加的“名流大会”，决定墨西哥实行“世袭君主制”，扶植奥地利大公马克西米利安为傀儡皇帝（即墨西哥第二帝国的马西米连诺一世），企图把墨西哥变成法国的附庸。

1865年秋，华雷斯将政府迁至美墨边境的北埃尔帕索（1888年改称华雷斯城），继续领导抗战。 为了发动群众参战和打击叛徒，华雷斯政府继续采取一些新的改革措施，如颁布《国有荒地分配法》《没收卖国贼财产法》，以及下令封闭女修道院，令修女还俗，将修道院房屋改为医院或兵站，财产充作军需等。同时，不断加强和巩固民族阵线，广泛开展游击战，在敌占区打击法军。

华雷斯号召全国人民团结一致保卫祖国，颁布法令对危及民族独立生存的国事犯处以死刑。马克西米利安曾试图赦免华雷斯，前提是华雷斯承认他的皇位，但遭到了拒绝。1865年4月，结束了南北战争的美国，开始给予华雷斯政府贷款并供应军火，同时坚持要求法国撤军。华雷斯对美国的扩张野心有所警惕。他说道：“我从来不抱这种幻想，即这个强国会给我们以真诚的帮助。”他认为拉丁美洲国家必须自求解放，互相支持，而绝不能依赖欧美列强的帮助。到1867年初，战局朝着有利于墨西哥的方向迅速发展。

法国在侵墨战争中，付出了损失6500人和3亿法郎的代价。1867年2月，处于内外交困的拿破仑三世被迫下令撤军。华雷斯乘势大举反攻，于2月进驻圣路易斯波多西。5月11日马克西米利安在克雷塔罗试图突围时被俘，6月19日被枪决。墨西哥人民在华雷斯领导下，取得反干涉战争的最后胜利。7月15日，华雷斯凯旋进入墨西哥城。

墨西哥人民经过五年力量悬殊的斗争获得了胜利，世界各地纷纷向共和派致敬和祝贺。墨西哥政府和华雷斯本人收到美国、加拿大以及欧洲和拉丁美洲好些国家社会团体的许多祝贺函电。

1867年，华雷斯第三次当选总统。他在第三个总统任期内大力进行战后恢复工作，修筑铁路，兴办教育，在每个村庄设立印第安人初级学校；裁减军队，以减轻政府的财政负担和削弱军人干涉政治的势力。但华雷斯未能完全稳定政局，仍不时遭到地方叛乱势力的反对。1868年至1871年间，先后有11个州发生反政府的叛乱，都被平服。1870年，华雷斯颁布大赦法令，力图争取地方势力，促进全国政治安定。

1871年10月，华雷斯第四次当选为总统。这次他遭到自由派内部的反对。他的一员主要部将波菲里奥·迪亚斯由于竞选总统失败，在瓦哈卡州发动叛乱。不久后迪亚斯被击败，逃往奇瓦瓦州。1872年春，各州暴乱相继平服，全国恢复了平静。在大体平息这次叛乱前后，华雷斯患难与共的妻子玛格丽塔离开了人世。爱妻去世带来的伤痛，加之政敌不断的攻击，使他的身体状况自此每况愈下。

1872年3月20日，华雷斯的心绞痛第一次发作。7月中旬，他在接待群众时再次发病。7月17日，华雷斯的病情急剧恶化。在此期间，他仍坚持处理公务，表现出顽强的生命力。18日11点35分，华雷斯在墨西哥城的国家宫停止了呼吸，终年66岁。19日凌晨五时，墨西哥城阅兵广场发出21声炮响，以示哀悼。闻讯而来的人群涌向阅兵广场，为华雷斯的逝世而哭泣。22日，墨西哥政府为他举行了国葬，将其遗体葬于圣斐南多神庙中。此后每年的3月21日（华雷斯诞辰）及7月18日成为了墨西哥国家重要的纪念节日。

华雷斯领导了19世纪50、60年代的墨西哥“革新运动”，推翻独裁政权。在司法部长至总统任内，华雷斯先后颁布《华雷斯法》、《墨西哥社会改革宣言》（即《改革法》），并参与领导制订1857年宪法，推行自由主义改革，被称为改革之父。他的名言是：“尊重他人的权利就是和平。”

《华雷斯法》是墨西改革哥改革运动中第一项重要法令，共77条。《华雷斯法》废除了自西班牙殖民时代沿续下来的天主教会和军人的特权（“福埃罗”），严格限制宗教法庭和军事法庭的司法权限教士和军人若触犯民法和刑法，与普通公民一样也受一般法庭审判，而不再交宗教法庭或军事法庭审理。此法沉重打击了保守派的支柱教会和军队的势力，后被纳人1857年宪法。

他在1859年7月制订的《改革法》规定：保守派教权集团是内战的罪魁祸首：无偿没收除教堂建筑物以外的教会全部土地财产，把收归国有的教会地产分成小块出售给农民，废除什一税和教会其它捐税，解散男修道院，并宣布宗教信仰完全自由，重申政教分离：取消教士的世俗权利，由政府接管国民教育及其它民事管理，政府对宗教事务实行干预等。

革新运动基本上摧毁了天主教会教权集团的经济垄断和精神统治，推动了民主思想的传播。它剥夺了教会的全部土地财产，并将其廉价卖给本国地主资产阶级分子、外国资本家以及一部分农民和城镇居民。据统计，到1866年3月为止，被剥夺的教会资产总值超过6200万比索。自革新运动以后，天主教会在墨西哥再也不能恢复它昔日的特权地位。同时，通过局部土改，墨西哥政府在一定程度上改善了部分农民的处境，使自耕农在1866年至1883年间增加了3182户。

总的来说，墨西哥革新运动反映了墨西哥自由派发展资本主义的要求，打击封建军阀与教权集团特权，确立资产阶级民主法制，取得了重大的成就。但也有观点认为，革新运动是一次很不彻底的资产阶级革命，对内无法根除封建制度的经济基础大土地所有制和大庄园制，相反由于拍卖教会地产和部分村社公地的结果，实际上大都落到新老世俗地主和军阀官僚手中。在对外方面，欧美列强的经济势力没有触动。华雷斯病逝后，原自由派将领波菲里奥·迪亚斯在美国的支持下发动政变上台，复辟了地主阶级的政权。此后，迪亚斯实行了长达30多年的独裁统治，欧美列强乘机加紧扩张势力，墨西哥迅速沦为受帝国主义控制与掠夺的半殖民地半封建国家。

在对外关系方面。1861年至1867年，华雷斯领导墨西哥人民取得抗法卫国的“第二次独立战争”的胜利。华雷斯政府领导的抗法卫国战争，赶走了法国侵略军，捍卫了国家的独立，加强了国防力量，促进了民族觉醒，从而消除了墨西哥重新沦为殖民地的威胁，暂时延缓了其半殖民地化的过程。

在卫国战争中，以华雷斯为首的自由派逐步形成了“解放的拉丁美洲主义”，其基本思想是把墨西哥的命运同整个拉丁美洲的解放斗争联系在一起，在共同斗争中团结一致，互相支持；并强调拉丁美洲各国必须自求解放，而绝不指靠欧美列强的帮助。1866年1月，华雷斯在谈到推行扩张政策的美国时说：“我从来没有这种幻想，即这个强国会给我们以真诚的帮助。我懂得，富者与强者是不会同情不幸的穷人的，更不会帮助穷人摆脱不幸的地位。”

在第三个总统任期中，华雷斯致力于重建长期遭受战争破坏的国家，设法恢复和发展陷于衰落的经济。在政府计划的安排下，铺设了一些新的公路，着手修筑铁路。华雷斯非常重视印第安人的教育。他下令在城镇和村庄普遍设立初等学校，为印第安人的子弟提供较多受教育的机会，到1872年，全国在校学生的人数达到20万。为了减轻政府的财政负担和削弱军人干涉政治的势力，华雷斯裁减了三分之二以上的军队，使军费开支大大降低。但是改革进展非常缓慢，华雷斯也未能完全稳定政局。

华雷斯一生为捍卫墨西哥民族的独立、打击国内封建势力立下了不朽功勋，成为墨西哥国家统一、政治民主和社会进步事业的奠基人之一。墨西哥人民尊他为最伟大的民族英雄和维护人民权利的斗士。后人也对他高度评价，称他为“墨西哥各族人民中最先进的人物”，“墨西哥自由派中最伟大的人物”，“给予墨西哥以新方向的伟人”，“人民的赤子”。

法国作家维克多·雨果在致华雷斯的贺词中颂扬他说：现今美洲有两个英雄，约翰·布朗和您，约翰·布朗使奴隶制度灭亡，您使自由复活。墨西哥被一种思想和一个人所拯救，这个思想就是共和国的思想，这个人就是您。

意大利革命家朱塞佩·加里波第写道：向你们致敬，英勇的墨西哥人民！我羡慕你们保卫自己美好共和国的自由使其不受专制雇佣兵侵犯的钢铁般的坚毅精神。向你致敬，胡阿雷斯，世界自由和人类尊严的战士！向你致敬！……意大利人民因为感谢你消灭他们的压迫者的伙计而向你致敬！

哥伦比亚合众国国会曾颁布了一项法令，宣布国会代表哥伦比亚人民向他致敬，表彰华雷斯在捍卫墨西哥自由和独立方面的坚持。华雷斯逝世后，多米尼加共和国国会立即颁发法令，尊称华雷斯是“美洲的伟人”。

墨西哥政治家伊格纳西奥·曼努埃尔·阿尔塔米拉诺在谈到华雷斯的逝世时写道：“胡亚雷斯的去世震惊了墨西哥。公正地说，连那些在当今的政治生活中最激烈地反对他的人，也没因他的去世而兴高采烈，虽然他的死除去了他们实现自己宿愿的最大障碍。武器从战士们的手中掉落下来。整个国家都为胡亚雷斯举哀。一个人死后不久，就使别人对他的怨恨冰消瓦解，这种情况并不多见。贝尼托·胡亚雷斯对祖国和民主所作的贡献有口皆碑，他受到全国人民的称颂，尊敬和钦佩。”

西班牙演说家、历史学家埃米略·卡斯特拉尔（1832-1899）在得悉华雷斯去世的噩耗后，发表了一篇悼念演说，表达了西班牙自由派对他的敬意：

胡亚雷斯的伟大主要是由于他对法制的虔诚的信仰，随着时间的推移，他的伟大将有增无减，并将得到历史的肯定。他以最高法院院长的身分接过行政大权后，便不避风险，不怕任何人反对，象法官那样一丝不苟地行使这个权力。一个个叛贰，集团向他挑战，他都用法律的力量将之击溃；教士们煽起种种迷信来反对他，他处之泰然，使他们不敢贸然将他革除教籍；军队不愿承认穿着法官长袍的人可以成为权力和秩序的象征——因为历来只有军人才能起这样的作用，他便战胜了军队的对抗；欧洲各国政府结成反对他的联盟，他使这个联盟迅速瓦解；一个军事的专制帝国在共和国的土地上冒头，他便将这个帝国彻底埋葬，他的力量来自于他的信念，他的伟大来自权利的纯正思想和法律的至高无上的威严。他使毁于阴险的列强之手的祖国和共和国得以复兴。但他最大的动绩却是粉碎了一切叛乱集团和叛乱分子，从而保住了合法政府。因此当胡亚雷斯逝世之后，最高法院院长便接替他担任共和国总统，墨西哥可以向世人表明，在那里，国家秩序并不为军人或集团所左右，而是象宇宙服从其固有的规律一样，受到法律的支配。

华雷斯的曾外孙巴勃罗·普里达·圣塔西利亚在他的著作《继承华雷斯的事业》中写道：“胡亚雷斯并非如许多人所说的那样是个毫不妥协的激进分子。他不是一个无动于衷的、铁石心肠的人，但也不是一个好动感情的人。他不是完人，但他的不足与他的伟大相比，却是那样的无足轻重。”此外，学者佩德罗·德·阿尔瓦在谈到华雷斯的品格时说：“当代最优秀的人物是贝尼托·胡亚雷斯。”

西班牙的历史学家贝雷·弗伊克斯在所撰《胡亚雷斯传》中饱含深情地陈述：

美国共产党著名领导人威廉·泽布朗·福斯特曾经指出，华雷斯是“墨西哥伟大的民族主义者”，“基本上代表中产阶级”。

美国学者派克斯（Henry Bamford Parks）在《墨西哥史》中曾对华雷斯有过这样的描写：这个从瓦哈卡山里来的矮小而肤色黝黑的胡亚雷斯，……不常说话，……然而他在最高的程度上具有墨西哥最需要的品质：彻底而诚实，决不承认妥协或失败的一种不可屈服的意志。他在欧洲的自由主义思想上带进了一种印第安人的朴质和顽强以及三百年前夸乌特莫克抵抗科尔特斯的决不屈服的勇敢。

中国学者李春辉《拉丁美洲史稿》：

中国学者杨典求在《外国历史大事集·近代部分》“胡亚雷斯改革”一节中评价：胡亚雷斯改革……实质上是一次资产阶级革命。这场席卷墨西哥全国，有广大人民群众参加的革命斗争，以其英勇反抗封建统治和外来侵略的光辉业绩而彪炳于墨西哥史册，并成为十九世纪拉丁美洲人民捍卫民族独立和争取社会进步的一个范例。领导这场伟大斗争的胡亚雷斯，被尊为拉丁美洲解放运动的伟大先行者。

墨西哥现任总统安德烈斯·曼努埃尔·洛佩斯·奥夫拉多尔认为华雷斯是墨西哥历史上最好的总统。

也有学者批评华雷斯是个理想主义者，认为他倡导来白欧美的自由主义原则不适合墨西哥的国情。有些人则指责他在1859年为换取美国的承认和援助，接受了相当苛刻的条件。

华雷斯主政以来颁布的主要法令有：

其撰写的部分信件有：

另外，华雷斯的《誓死保卫独立》（1847）、《在神圣的原则面前——在奇瓦瓦州的答谢祝酒词》（1865）、《祖国的胜利》（1867）等演说词亦在中国译著中广泛流传，颇受称赞。

1843年，37岁的华雷斯同比他小20岁的姑娘玛格丽塔结婚。玛格丽塔是马萨夫妇的女儿。胡亚雷斯的长相一般，个子矮小，皮肤黝黑；而玛格丽塔则身材苗条，皮肤白净，一对大大的眼睛很能传神，而且娴雅知礼，善理家务。但华雷斯“像海洋一般宽广的胸怀，勇敢而又高尚的行动”，深深地打动了玛格丽塔的心。华雷斯的求婚立即被玛格丽塔和她的父母接受。玛格丽塔在给她的一个女友的信中这样描写华雷斯：“他长得很丑，但人品非常好。”她理解丈夫的志趣和品格，懂得国家需要像他那样有才干而又正直的人。婚后，她虽然时常为华雷斯的安全担忧，但从不在华雷斯面前表露，总是用亲切的、充满敬意的话鼓励他。华雷斯得到玛格丽塔的爱情后，似乎更加自信，甚至性格也起了变化，由腼腆、寡言变得更加潇洒。当华雷斯流亡美国时，衣服褴楼，身无分文。在新奥尔良州，他在一个小旅店里租了一间小房间，在一个烟草工厂里找到了工作。而玛格丽塔仍在瓦哈卡，开了一家杂货店以维持家庭生活，并时而寄钱帮助华雷斯。1871年，玛格丽塔去世，华雷斯心碎不已，变得比以前更加沉默寡言。为了抑制痛苦，他埋头工作，以摆脱内心的哀伤和万千愁绪，身体逐渐衰弱。他办公室椅子对面的墙上，挂着一幅很大的玛格丽塔肖像，华雷斯在生命的最后一段时间，总是凝视着它。1872年，华雷斯因心脏病病逝。后人总结二人的关系道：“胡亚雷斯是爱国主义的典范，他在惊涛骇浪和巨大的不幸中度过了一生，但他得到一位深居闺阁，不慕虚荣的女子的爱情。她与伟大的胡亚雷斯结合之后，总是设法使她那紧握着法律与权利的武器、在墨西哥的土地上东奔西走的丈夫减少痛苦……。”

华雷斯重视妇女教育，认为提高妇女的文化素质就是培植社会革新和进步的幼芽。同时，他反对教会的繁文缛节。有一次，华雷斯的一个朋友向他埋怨自己的女儿迷上了跳舞。华雷斯回答：“我并不主张女孩子们都去跳舞。她们能做一些更有意义的事情当然更好。但如果要在适当的娱乐和没完没了的祈祷或忏悔之间进行选择，我看不妨去跳跳舞。”

胡亚雷斯谦虚、和善，他向所有的人敞开家门及总统办公室的大门。有时他走出国家宫，到离国家宫不远的拉莫内达大街的一家理发馆理发。理发师为他刮脸、理发时，他就与理发师亲切交谈。

马西米连诺皇帝被俘后，被墨西哥的军事法庭以颠覆墨西哥共和国的罪名判处枪决。得知此消息后，欧洲各国君主、美国总统安德鲁·约翰逊，甚至雨果、加里波第等民主人士都致信华雷斯，要求其不要枪决皇帝，均遭到华雷斯的拒绝。据说在宣判马西米连诺死刑的那天，他曾引用拿破仑·波拿巴的语录：“不错，我的确身材矮小。然而谁若因此而藐视我，我将砍下他的脑袋，以消除这种差别。”（一说他的回答是：“要他命的不是我，而是法律和人民！”）1867年6月19日凌晨三点，马西米连诺被执行死刑。

（表格主要参考资料）

墨西哥北部奇瓦瓦州的华雷斯城（原名北埃尔帕索）也是为纪念华雷斯而命名的。

在墨西哥首都墨西哥城的国民宫北侧大门进去，是名为马里亚诺的庭院。过道上，竖立着一尊华雷斯的青铜雕像。这尊雕像是用在华雷斯领导的改革战争中，从保守派军队手中缴获来的大炮的青铜铸成的。正对雕像的北门通往华雷斯的办公楼，现称为华雷斯区，已布置成为供人瞻仰的博物馆。博物馆前厅陈列着一幅华雷斯童年牧羊的彩色玻璃镶嵌画，四周饰有墨西哥共和国的国徽和31个州的州徽，下面题词写道：“当这位小孩成为墨西哥总统时，他摧毁了帝国，重建共和国。”前厅与华雷斯当年的接待室，办公室和卧室相连。

1910年，墨西哥政府在首都中心地区中央公园一端建立了华雷斯伟人祠。每年3月21日的华雷斯诞辰日，墨西哥总统等国家领导人都到伟人祠敬献花圈，总统还在伟人祠前举行的隆重纪念仪式上发表讲话。

墨西哥城有一条穿墨西哥城中心而过的“改革大道”，是为纪念华雷斯进行的改革事业而建。街道中心矗立着代表墨西哥革命精神的独立纪念碑，街道两侧有众多著名历史人物的纪念雕像，是全城最宽最美的林荫大道。此外，墨西哥城的华雷斯大街以华雷斯为命名。据统计，墨西哥城共有100多条用华雷斯命名的街道。

墨西哥瓜纳华托州首府瓜纳华托的华雷斯大剧院（Teatro Juarez）始建于1873年,竣工于1903年，用华雷斯的名字命名。