2022年7月28日，西班牙男篮官方公布了参加欧锦赛的22人大名单，胡安·努涅斯在列。8月24日，入选西班牙男篮公布的世预赛12人大名单。

2023年8月，西班牙篮协确认，由胡安·努涅斯顶替卢比奥。

2023年8月，入选西班牙公布的世界杯12人名单。男篮世界杯小组赛，西班牙96-78击败巴西提前小组出线。努涅斯出战23分钟，投篮6中4，三分4中2，罚球5中3，得到13分7板5助2断，并成功当选全场最佳。

2024年7月26日，巴萨男篮官方宣布，努涅斯加盟球队，双方签约三年。