更新时间：2022-11-13 11:53
自剪接(self-splicing)出现在稀少的内含子组成核酸酶，核酸酶在只有RNA的情况下代替了剪接体的功能。自剪接的内含子有两种，称为I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型内含子以与剪接体类似的方式进行剪接，但不需要任何蛋白质。这种相似性使人相信这些内含子与剪接体在演化过程上有着关连。自剪接亦可能是非常古老，且可能出现在一个未有蛋白质的核糖核酸世界。虽然以下两种剪接可以在没有蛋白质的情况下进行，但依然会额外的使用5个RNA分子及超过50多个蛋白质，并水解多个三磷酸腺苷（ATP）分子。使用 ATP 是要提高剪接mRNA的准确性，避免出现错误。
以下两次交酯化是I型内含子自剪接的特征：
浮游鸟嘌呤核苷酸（或在内含子中）的3'羟基，或是核苷酸辅助因子（即一磷酸鸟苷（GMP）、二磷酸鸟苷（GDP）、三磷酸鸟苷（GTP））攻击磷酸盐的5'剪接位点。
5'内含子的3'羟基变成亲核的，而第二次交酯化会将两个内含子接合。
以下是Ⅱ型内含子自剪接的特征（与I型相同是两次交酯化）：
内含子内特定腺苷的2'羟基攻击5'剪接位点，从而形成一个套索。
5'外显子的3'羟基于3'剪接位点引发第二次的交酯化，从而将两个外显子接合。