这份报告以中国2009—2010年在《自然》及其子刊上发表的包括论文、快报和综述在内的文章数量为参考，对中国的科研机构和城市进行了排名统计，同时，该报告也统计了中国在《科学》、《细胞》、《新英格兰医学杂志》以及《柳叶刀》上发表的文章数量。

报告显示，中国发表在《自然》系列杂志上的文章数量从2000年的6篇上升到2010年的149篇，而中国在《科学》、《细胞》、《新英格兰医学杂志》以及《柳叶刀》上发表的文章总数也从2000年的3篇增长到2010年的27篇。

在这份报告中，占据前10位的科研机构依次是：中国科学院、清华大学、中国科技大学、深圳华大基因研究院、北京大学、南京大学、香港大学、东南大学、厦门大学和浙江大学。

此外，该报告还公布2010年亚太地区排名前200的科研机构名单，中科院与清华大学进入前10名，分列第4与第7。而在“自然出版指数”全球50强榜单中，中科院是唯一上榜的中国科研机构，位列第32名。